Protein–RNA interactions for Protein: Q99NC0

Vgll1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll1Q99NC0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vgll1Q99NC0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vgll1Q99NC0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vgll1Q99NC0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vgll1Q99NC0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vgll1Q99NC0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vgll1Q99NC0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vgll1Q99NC0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vgll1Q99NC0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vgll1Q99NC0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vgll1Q99NC0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vgll1Q99NC0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vgll1Q99NC0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vgll1Q99NC0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vgll1Q99NC0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vgll1Q99NC0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vgll1Q99NC0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vgll1Q99NC0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vgll1Q99NC0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vgll1Q99NC0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vgll1Q99NC0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vgll1Q99NC0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vgll1Q99NC0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vgll1Q99NC0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Vgll1Q99NC0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vgll1Q99NC0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vgll1Q99NC0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vgll1Q99NC0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vgll1Q99NC0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vgll1Q99NC0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vgll1Q99NC0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vgll1Q99NC0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vgll1Q99NC0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vgll1Q99NC0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vgll1Q99NC0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vgll1Q99NC0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vgll1Q99NC0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vgll1Q99NC0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vgll1Q99NC0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vgll1Q99NC0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vgll1Q99NC0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vgll1Q99NC0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vgll1Q99NC0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vgll1Q99NC0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vgll1Q99NC0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vgll1Q99NC0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vgll1Q99NC0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vgll1Q99NC0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vgll1Q99NC0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vgll1Q99NC0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vgll1Q99NC0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vgll1Q99NC0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vgll1Q99NC0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vgll1Q99NC0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vgll1Q99NC0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vgll1Q99NC0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vgll1Q99NC0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vgll1Q99NC0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vgll1Q99NC0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vgll1Q99NC0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vgll1Q99NC0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vgll1Q99NC0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vgll1Q99NC0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vgll1Q99NC0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vgll1Q99NC0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vgll1Q99NC0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vgll1Q99NC0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vgll1Q99NC0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vgll1Q99NC0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Vgll1Q99NC0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vgll1Q99NC0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vgll1Q99NC0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vgll1Q99NC0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vgll1Q99NC0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vgll1Q99NC0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vgll1Q99NC0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vgll1Q99NC0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vgll1Q99NC0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vgll1Q99NC0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vgll1Q99NC0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vgll1Q99NC0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vgll1Q99NC0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vgll1Q99NC0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vgll1Q99NC0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vgll1Q99NC0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vgll1Q99NC0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vgll1Q99NC0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vgll1Q99NC0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vgll1Q99NC0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vgll1Q99NC0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vgll1Q99NC0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vgll1Q99NC0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vgll1Q99NC0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vgll1Q99NC0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vgll1Q99NC0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vgll1Q99NC0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vgll1Q99NC0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vgll1Q99NC0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vgll1Q99NC0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vgll1Q99NC0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms