Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atoh8Q99NA2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atoh8Q99NA2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atoh8Q99NA2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atoh8Q99NA2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atoh8Q99NA2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atoh8Q99NA2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atoh8Q99NA2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atoh8Q99NA2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atoh8Q99NA2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atoh8Q99NA2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atoh8Q99NA2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Atoh8Q99NA2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atoh8Q99NA2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atoh8Q99NA2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atoh8Q99NA2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atoh8Q99NA2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atoh8Q99NA2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atoh8Q99NA2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atoh8Q99NA2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atoh8Q99NA2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atoh8Q99NA2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Atoh8Q99NA2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atoh8Q99NA2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atoh8Q99NA2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atoh8Q99NA2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atoh8Q99NA2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atoh8Q99NA2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atoh8Q99NA2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atoh8Q99NA2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atoh8Q99NA2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atoh8Q99NA2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Atoh8Q99NA2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atoh8Q99NA2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atoh8Q99NA2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atoh8Q99NA2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atoh8Q99NA2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atoh8Q99NA2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atoh8Q99NA2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atoh8Q99NA2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atoh8Q99NA2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atoh8Q99NA2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atoh8Q99NA2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Atoh8Q99NA2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atoh8Q99NA2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atoh8Q99NA2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atoh8Q99NA2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Atoh8Q99NA2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atoh8Q99NA2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atoh8Q99NA2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atoh8Q99NA2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atoh8Q99NA2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atoh8Q99NA2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atoh8Q99NA2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Atoh8Q99NA2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atoh8Q99NA2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Atoh8Q99NA2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atoh8Q99NA2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atoh8Q99NA2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Atoh8Q99NA2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atoh8Q99NA2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atoh8Q99NA2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atoh8Q99NA2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atoh8Q99NA2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atoh8Q99NA2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atoh8Q99NA2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atoh8Q99NA2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atoh8Q99NA2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atoh8Q99NA2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atoh8Q99NA2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atoh8Q99NA2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atoh8Q99NA2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atoh8Q99NA2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atoh8Q99NA2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atoh8Q99NA2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atoh8Q99NA2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atoh8Q99NA2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atoh8Q99NA2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atoh8Q99NA2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atoh8Q99NA2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atoh8Q99NA2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atoh8Q99NA2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Atoh8Q99NA2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Atoh8Q99NA2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Atoh8Q99NA2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atoh8Q99NA2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atoh8Q99NA2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atoh8Q99NA2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atoh8Q99NA2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atoh8Q99NA2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atoh8Q99NA2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atoh8Q99NA2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atoh8Q99NA2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atoh8Q99NA2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atoh8Q99NA2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atoh8Q99NA2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atoh8Q99NA2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atoh8Q99NA2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atoh8Q99NA2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atoh8Q99NA2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms