Protein–RNA interactions for Protein: Q99MP8

Brap, BRCA1-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrapQ99MP8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BrapQ99MP8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BrapQ99MP8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BrapQ99MP8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BrapQ99MP8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BrapQ99MP8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
BrapQ99MP8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BrapQ99MP8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BrapQ99MP8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BrapQ99MP8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BrapQ99MP8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BrapQ99MP8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BrapQ99MP8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BrapQ99MP8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BrapQ99MP8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BrapQ99MP8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BrapQ99MP8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BrapQ99MP8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BrapQ99MP8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BrapQ99MP8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BrapQ99MP8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BrapQ99MP8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BrapQ99MP8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BrapQ99MP8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BrapQ99MP8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BrapQ99MP8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BrapQ99MP8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BrapQ99MP8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BrapQ99MP8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BrapQ99MP8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BrapQ99MP8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BrapQ99MP8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BrapQ99MP8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BrapQ99MP8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BrapQ99MP8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BrapQ99MP8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BrapQ99MP8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BrapQ99MP8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BrapQ99MP8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BrapQ99MP8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
BrapQ99MP8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BrapQ99MP8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BrapQ99MP8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BrapQ99MP8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BrapQ99MP8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BrapQ99MP8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BrapQ99MP8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BrapQ99MP8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BrapQ99MP8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
BrapQ99MP8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BrapQ99MP8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BrapQ99MP8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BrapQ99MP8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BrapQ99MP8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BrapQ99MP8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BrapQ99MP8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BrapQ99MP8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BrapQ99MP8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BrapQ99MP8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BrapQ99MP8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
BrapQ99MP8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms