Protein–RNA interactions for Protein: Q99MJ9

Ddx50, ATP-dependent RNA helicase DDX50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx50Q99MJ9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx50Q99MJ9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx50Q99MJ9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx50Q99MJ9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx50Q99MJ9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx50Q99MJ9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx50Q99MJ9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx50Q99MJ9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx50Q99MJ9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx50Q99MJ9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx50Q99MJ9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx50Q99MJ9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx50Q99MJ9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx50Q99MJ9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx50Q99MJ9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx50Q99MJ9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx50Q99MJ9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx50Q99MJ9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx50Q99MJ9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx50Q99MJ9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx50Q99MJ9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx50Q99MJ9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx50Q99MJ9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx50Q99MJ9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx50Q99MJ9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx50Q99MJ9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx50Q99MJ9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx50Q99MJ9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx50Q99MJ9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ddx50Q99MJ9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ddx50Q99MJ9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx50Q99MJ9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx50Q99MJ9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx50Q99MJ9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx50Q99MJ9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx50Q99MJ9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx50Q99MJ9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx50Q99MJ9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx50Q99MJ9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx50Q99MJ9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx50Q99MJ9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx50Q99MJ9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx50Q99MJ9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx50Q99MJ9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx50Q99MJ9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx50Q99MJ9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx50Q99MJ9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx50Q99MJ9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx50Q99MJ9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx50Q99MJ9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx50Q99MJ9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx50Q99MJ9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx50Q99MJ9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx50Q99MJ9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx50Q99MJ9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx50Q99MJ9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx50Q99MJ9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx50Q99MJ9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx50Q99MJ9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx50Q99MJ9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx50Q99MJ9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx50Q99MJ9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx50Q99MJ9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx50Q99MJ9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx50Q99MJ9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx50Q99MJ9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx50Q99MJ9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx50Q99MJ9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddx50Q99MJ9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddx50Q99MJ9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddx50Q99MJ9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddx50Q99MJ9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddx50Q99MJ9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddx50Q99MJ9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddx50Q99MJ9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ddx50Q99MJ9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx50Q99MJ9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx50Q99MJ9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx50Q99MJ9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx50Q99MJ9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx50Q99MJ9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx50Q99MJ9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx50Q99MJ9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx50Q99MJ9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx50Q99MJ9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx50Q99MJ9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ddx50Q99MJ9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ddx50Q99MJ9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ddx50Q99MJ9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ddx50Q99MJ9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx50Q99MJ9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx50Q99MJ9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx50Q99MJ9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx50Q99MJ9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx50Q99MJ9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx50Q99MJ9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx50Q99MJ9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx50Q99MJ9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx50Q99MJ9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx50Q99MJ9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms