Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB3

Tm2d1, TM2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d1Q99MB3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tm2d1Q99MB3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tm2d1Q99MB3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tm2d1Q99MB3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tm2d1Q99MB3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tm2d1Q99MB3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tm2d1Q99MB3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tm2d1Q99MB3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tm2d1Q99MB3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tm2d1Q99MB3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tm2d1Q99MB3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tm2d1Q99MB3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tm2d1Q99MB3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tm2d1Q99MB3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tm2d1Q99MB3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tm2d1Q99MB3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tm2d1Q99MB3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tm2d1Q99MB3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tm2d1Q99MB3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tm2d1Q99MB3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tm2d1Q99MB3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tm2d1Q99MB3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tm2d1Q99MB3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tm2d1Q99MB3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tm2d1Q99MB3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tm2d1Q99MB3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tm2d1Q99MB3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tm2d1Q99MB3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tm2d1Q99MB3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tm2d1Q99MB3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tm2d1Q99MB3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tm2d1Q99MB3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tm2d1Q99MB3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tm2d1Q99MB3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tm2d1Q99MB3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tm2d1Q99MB3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tm2d1Q99MB3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tm2d1Q99MB3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms