Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rcbtb2Q99LJ7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rcbtb2Q99LJ7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rcbtb2Q99LJ7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rcbtb2Q99LJ7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rcbtb2Q99LJ7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rcbtb2Q99LJ7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rcbtb2Q99LJ7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms