Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pagr1aQ99L02 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pagr1aQ99L02 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pagr1aQ99L02 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pagr1aQ99L02 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pagr1aQ99L02 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pagr1aQ99L02 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pagr1aQ99L02 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pagr1aQ99L02 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Pagr1aQ99L02 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pagr1aQ99L02 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pagr1aQ99L02 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pagr1aQ99L02 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pagr1aQ99L02 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pagr1aQ99L02 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pagr1aQ99L02 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pagr1aQ99L02 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pagr1aQ99L02 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pagr1aQ99L02 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pagr1aQ99L02 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pagr1aQ99L02 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pagr1aQ99L02 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pagr1aQ99L02 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pagr1aQ99L02 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pagr1aQ99L02 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pagr1aQ99L02 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pagr1aQ99L02 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pagr1aQ99L02 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pagr1aQ99L02 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pagr1aQ99L02 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pagr1aQ99L02 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pagr1aQ99L02 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pagr1aQ99L02 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pagr1aQ99L02 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pagr1aQ99L02 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pagr1aQ99L02 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pagr1aQ99L02 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pagr1aQ99L02 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Pagr1aQ99L02 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pagr1aQ99L02 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Pagr1aQ99L02 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pagr1aQ99L02 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pagr1aQ99L02 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pagr1aQ99L02 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pagr1aQ99L02 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pagr1aQ99L02 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pagr1aQ99L02 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pagr1aQ99L02 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pagr1aQ99L02 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pagr1aQ99L02 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pagr1aQ99L02 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pagr1aQ99L02 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pagr1aQ99L02 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pagr1aQ99L02 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pagr1aQ99L02 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pagr1aQ99L02 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pagr1aQ99L02 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pagr1aQ99L02 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pagr1aQ99L02 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Pagr1aQ99L02 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pagr1aQ99L02 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pagr1aQ99L02 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pagr1aQ99L02 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pagr1aQ99L02 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pagr1aQ99L02 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pagr1aQ99L02 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pagr1aQ99L02 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pagr1aQ99L02 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pagr1aQ99L02 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pagr1aQ99L02 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pagr1aQ99L02 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Pagr1aQ99L02 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pagr1aQ99L02 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pagr1aQ99L02 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pagr1aQ99L02 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pagr1aQ99L02 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pagr1aQ99L02 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Pagr1aQ99L02 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pagr1aQ99L02 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pagr1aQ99L02 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pagr1aQ99L02 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pagr1aQ99L02 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pagr1aQ99L02 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pagr1aQ99L02 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pagr1aQ99L02 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pagr1aQ99L02 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pagr1aQ99L02 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pagr1aQ99L02 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pagr1aQ99L02 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pagr1aQ99L02 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pagr1aQ99L02 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pagr1aQ99L02 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pagr1aQ99L02 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pagr1aQ99L02 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Pagr1aQ99L02 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Pagr1aQ99L02 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pagr1aQ99L02 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pagr1aQ99L02 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pagr1aQ99L02 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Pagr1aQ99L02 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms