Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vmp1Q99KU0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vmp1Q99KU0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vmp1Q99KU0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vmp1Q99KU0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vmp1Q99KU0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vmp1Q99KU0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vmp1Q99KU0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Vmp1Q99KU0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vmp1Q99KU0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Vmp1Q99KU0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vmp1Q99KU0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vmp1Q99KU0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vmp1Q99KU0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vmp1Q99KU0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vmp1Q99KU0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vmp1Q99KU0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vmp1Q99KU0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vmp1Q99KU0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vmp1Q99KU0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vmp1Q99KU0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vmp1Q99KU0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vmp1Q99KU0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Vmp1Q99KU0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vmp1Q99KU0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vmp1Q99KU0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vmp1Q99KU0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vmp1Q99KU0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vmp1Q99KU0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vmp1Q99KU0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vmp1Q99KU0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vmp1Q99KU0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vmp1Q99KU0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vmp1Q99KU0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vmp1Q99KU0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vmp1Q99KU0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vmp1Q99KU0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vmp1Q99KU0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vmp1Q99KU0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vmp1Q99KU0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vmp1Q99KU0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vmp1Q99KU0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vmp1Q99KU0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vmp1Q99KU0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vmp1Q99KU0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vmp1Q99KU0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vmp1Q99KU0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vmp1Q99KU0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vmp1Q99KU0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vmp1Q99KU0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vmp1Q99KU0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vmp1Q99KU0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vmp1Q99KU0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmp1Q99KU0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmp1Q99KU0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmp1Q99KU0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmp1Q99KU0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmp1Q99KU0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmp1Q99KU0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmp1Q99KU0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmp1Q99KU0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmp1Q99KU0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmp1Q99KU0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmp1Q99KU0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmp1Q99KU0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmp1Q99KU0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmp1Q99KU0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmp1Q99KU0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmp1Q99KU0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmp1Q99KU0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vmp1Q99KU0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vmp1Q99KU0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vmp1Q99KU0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vmp1Q99KU0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmp1Q99KU0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmp1Q99KU0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmp1Q99KU0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmp1Q99KU0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmp1Q99KU0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmp1Q99KU0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmp1Q99KU0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmp1Q99KU0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmp1Q99KU0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmp1Q99KU0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmp1Q99KU0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmp1Q99KU0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmp1Q99KU0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmp1Q99KU0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmp1Q99KU0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmp1Q99KU0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmp1Q99KU0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmp1Q99KU0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmp1Q99KU0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmp1Q99KU0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmp1Q99KU0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmp1Q99KU0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmp1Q99KU0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmp1Q99KU0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmp1Q99KU0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmp1Q99KU0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 791.9 ms