Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Reep3Q99KK1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Reep3Q99KK1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Reep3Q99KK1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Reep3Q99KK1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Reep3Q99KK1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Reep3Q99KK1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Reep3Q99KK1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Reep3Q99KK1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Reep3Q99KK1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Reep3Q99KK1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Reep3Q99KK1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Reep3Q99KK1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Reep3Q99KK1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Reep3Q99KK1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Reep3Q99KK1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Reep3Q99KK1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Reep3Q99KK1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Reep3Q99KK1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Reep3Q99KK1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Reep3Q99KK1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Reep3Q99KK1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Reep3Q99KK1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Reep3Q99KK1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Reep3Q99KK1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Reep3Q99KK1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Reep3Q99KK1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Reep3Q99KK1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Reep3Q99KK1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Reep3Q99KK1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Reep3Q99KK1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Reep3Q99KK1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Reep3Q99KK1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Reep3Q99KK1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Reep3Q99KK1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Reep3Q99KK1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Reep3Q99KK1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Reep3Q99KK1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Reep3Q99KK1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Reep3Q99KK1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Reep3Q99KK1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Reep3Q99KK1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Reep3Q99KK1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Reep3Q99KK1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Reep3Q99KK1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Reep3Q99KK1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Reep3Q99KK1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Reep3Q99KK1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Reep3Q99KK1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Reep3Q99KK1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Reep3Q99KK1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Reep3Q99KK1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Reep3Q99KK1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Reep3Q99KK1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Reep3Q99KK1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Reep3Q99KK1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Reep3Q99KK1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Reep3Q99KK1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Reep3Q99KK1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Reep3Q99KK1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Reep3Q99KK1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Reep3Q99KK1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Reep3Q99KK1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Reep3Q99KK1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Reep3Q99KK1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Reep3Q99KK1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Reep3Q99KK1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Reep3Q99KK1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Reep3Q99KK1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Reep3Q99KK1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Reep3Q99KK1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Reep3Q99KK1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Reep3Q99KK1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Reep3Q99KK1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Reep3Q99KK1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Reep3Q99KK1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Reep3Q99KK1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Reep3Q99KK1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Reep3Q99KK1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Reep3Q99KK1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Reep3Q99KK1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Reep3Q99KK1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Reep3Q99KK1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Reep3Q99KK1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Reep3Q99KK1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Reep3Q99KK1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Reep3Q99KK1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Reep3Q99KK1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Reep3Q99KK1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Reep3Q99KK1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Reep3Q99KK1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Reep3Q99KK1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Reep3Q99KK1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Reep3Q99KK1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Reep3Q99KK1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Reep3Q99KK1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Reep3Q99KK1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Reep3Q99KK1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Reep3Q99KK1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Reep3Q99KK1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms