Protein–RNA interactions for Protein: Q99JZ0

Sdcbp2, Syntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdcbp2Q99JZ0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sdcbp2Q99JZ0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sdcbp2Q99JZ0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sdcbp2Q99JZ0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sdcbp2Q99JZ0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sdcbp2Q99JZ0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sdcbp2Q99JZ0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sdcbp2Q99JZ0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sdcbp2Q99JZ0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sdcbp2Q99JZ0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sdcbp2Q99JZ0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sdcbp2Q99JZ0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Sdcbp2Q99JZ0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sdcbp2Q99JZ0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sdcbp2Q99JZ0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sdcbp2Q99JZ0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sdcbp2Q99JZ0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sdcbp2Q99JZ0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sdcbp2Q99JZ0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sdcbp2Q99JZ0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sdcbp2Q99JZ0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sdcbp2Q99JZ0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sdcbp2Q99JZ0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sdcbp2Q99JZ0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Sdcbp2Q99JZ0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sdcbp2Q99JZ0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sdcbp2Q99JZ0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sdcbp2Q99JZ0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sdcbp2Q99JZ0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sdcbp2Q99JZ0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sdcbp2Q99JZ0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sdcbp2Q99JZ0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sdcbp2Q99JZ0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sdcbp2Q99JZ0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Sdcbp2Q99JZ0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sdcbp2Q99JZ0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sdcbp2Q99JZ0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sdcbp2Q99JZ0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sdcbp2Q99JZ0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sdcbp2Q99JZ0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sdcbp2Q99JZ0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sdcbp2Q99JZ0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sdcbp2Q99JZ0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Sdcbp2Q99JZ0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sdcbp2Q99JZ0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sdcbp2Q99JZ0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sdcbp2Q99JZ0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sdcbp2Q99JZ0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sdcbp2Q99JZ0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sdcbp2Q99JZ0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sdcbp2Q99JZ0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sdcbp2Q99JZ0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Sdcbp2Q99JZ0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sdcbp2Q99JZ0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sdcbp2Q99JZ0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sdcbp2Q99JZ0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sdcbp2Q99JZ0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sdcbp2Q99JZ0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sdcbp2Q99JZ0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sdcbp2Q99JZ0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sdcbp2Q99JZ0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sdcbp2Q99JZ0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sdcbp2Q99JZ0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sdcbp2Q99JZ0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sdcbp2Q99JZ0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sdcbp2Q99JZ0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sdcbp2Q99JZ0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sdcbp2Q99JZ0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sdcbp2Q99JZ0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sdcbp2Q99JZ0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sdcbp2Q99JZ0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Sdcbp2Q99JZ0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sdcbp2Q99JZ0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sdcbp2Q99JZ0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sdcbp2Q99JZ0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Sdcbp2Q99JZ0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sdcbp2Q99JZ0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sdcbp2Q99JZ0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sdcbp2Q99JZ0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sdcbp2Q99JZ0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sdcbp2Q99JZ0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Sdcbp2Q99JZ0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sdcbp2Q99JZ0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sdcbp2Q99JZ0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sdcbp2Q99JZ0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sdcbp2Q99JZ0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sdcbp2Q99JZ0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sdcbp2Q99JZ0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sdcbp2Q99JZ0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sdcbp2Q99JZ0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sdcbp2Q99JZ0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sdcbp2Q99JZ0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sdcbp2Q99JZ0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Sdcbp2Q99JZ0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sdcbp2Q99JZ0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Sdcbp2Q99JZ0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sdcbp2Q99JZ0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sdcbp2Q99JZ0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Sdcbp2Q99JZ0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sdcbp2Q99JZ0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms