Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Higd1bQ99JY6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Higd1bQ99JY6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Higd1bQ99JY6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Higd1bQ99JY6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Higd1bQ99JY6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Higd1bQ99JY6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Higd1bQ99JY6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Higd1bQ99JY6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Higd1bQ99JY6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Higd1bQ99JY6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Higd1bQ99JY6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Higd1bQ99JY6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Higd1bQ99JY6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Higd1bQ99JY6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Higd1bQ99JY6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Higd1bQ99JY6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Higd1bQ99JY6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Higd1bQ99JY6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Higd1bQ99JY6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Higd1bQ99JY6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Higd1bQ99JY6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Higd1bQ99JY6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Higd1bQ99JY6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Higd1bQ99JY6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Higd1bQ99JY6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Higd1bQ99JY6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Higd1bQ99JY6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Higd1bQ99JY6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Higd1bQ99JY6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Higd1bQ99JY6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Higd1bQ99JY6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Higd1bQ99JY6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Higd1bQ99JY6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Higd1bQ99JY6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Higd1bQ99JY6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Higd1bQ99JY6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Higd1bQ99JY6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Higd1bQ99JY6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Higd1bQ99JY6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Higd1bQ99JY6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Higd1bQ99JY6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Higd1bQ99JY6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Higd1bQ99JY6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Higd1bQ99JY6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Higd1bQ99JY6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Higd1bQ99JY6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Higd1bQ99JY6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Higd1bQ99JY6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Higd1bQ99JY6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Higd1bQ99JY6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Higd1bQ99JY6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Higd1bQ99JY6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Higd1bQ99JY6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Higd1bQ99JY6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Higd1bQ99JY6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Higd1bQ99JY6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Higd1bQ99JY6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Higd1bQ99JY6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Higd1bQ99JY6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Higd1bQ99JY6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Higd1bQ99JY6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Higd1bQ99JY6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Higd1bQ99JY6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Higd1bQ99JY6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Higd1bQ99JY6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Higd1bQ99JY6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Higd1bQ99JY6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Higd1bQ99JY6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Higd1bQ99JY6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Higd1bQ99JY6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Higd1bQ99JY6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Higd1bQ99JY6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Higd1bQ99JY6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Higd1bQ99JY6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Higd1bQ99JY6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Higd1bQ99JY6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Higd1bQ99JY6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Higd1bQ99JY6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Higd1bQ99JY6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Higd1bQ99JY6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Higd1bQ99JY6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Higd1bQ99JY6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Higd1bQ99JY6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Higd1bQ99JY6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Higd1bQ99JY6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Higd1bQ99JY6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Higd1bQ99JY6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Higd1bQ99JY6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Higd1bQ99JY6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Higd1bQ99JY6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Higd1bQ99JY6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Higd1bQ99JY6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Higd1bQ99JY6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Higd1bQ99JY6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Higd1bQ99JY6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Higd1bQ99JY6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Higd1bQ99JY6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Higd1bQ99JY6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Higd1bQ99JY6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms