Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT6

Tlcd1, Calfacilitin, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlcd1Q99JT6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tlcd1Q99JT6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tlcd1Q99JT6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tlcd1Q99JT6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tlcd1Q99JT6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tlcd1Q99JT6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tlcd1Q99JT6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tlcd1Q99JT6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tlcd1Q99JT6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tlcd1Q99JT6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tlcd1Q99JT6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tlcd1Q99JT6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tlcd1Q99JT6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tlcd1Q99JT6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tlcd1Q99JT6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tlcd1Q99JT6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tlcd1Q99JT6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tlcd1Q99JT6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tlcd1Q99JT6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tlcd1Q99JT6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tlcd1Q99JT6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tlcd1Q99JT6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tlcd1Q99JT6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tlcd1Q99JT6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tlcd1Q99JT6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tlcd1Q99JT6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tlcd1Q99JT6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tlcd1Q99JT6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tlcd1Q99JT6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tlcd1Q99JT6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tlcd1Q99JT6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tlcd1Q99JT6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tlcd1Q99JT6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tlcd1Q99JT6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tlcd1Q99JT6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tlcd1Q99JT6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tlcd1Q99JT6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tlcd1Q99JT6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tlcd1Q99JT6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tlcd1Q99JT6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tlcd1Q99JT6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tlcd1Q99JT6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tlcd1Q99JT6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tlcd1Q99JT6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tlcd1Q99JT6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tlcd1Q99JT6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tlcd1Q99JT6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tlcd1Q99JT6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tlcd1Q99JT6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tlcd1Q99JT6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tlcd1Q99JT6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tlcd1Q99JT6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tlcd1Q99JT6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tlcd1Q99JT6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tlcd1Q99JT6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tlcd1Q99JT6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tlcd1Q99JT6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tlcd1Q99JT6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tlcd1Q99JT6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tlcd1Q99JT6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tlcd1Q99JT6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tlcd1Q99JT6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tlcd1Q99JT6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tlcd1Q99JT6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tlcd1Q99JT6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tlcd1Q99JT6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tlcd1Q99JT6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tlcd1Q99JT6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tlcd1Q99JT6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tlcd1Q99JT6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tlcd1Q99JT6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tlcd1Q99JT6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tlcd1Q99JT6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tlcd1Q99JT6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tlcd1Q99JT6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tlcd1Q99JT6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tlcd1Q99JT6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tlcd1Q99JT6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tlcd1Q99JT6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tlcd1Q99JT6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tlcd1Q99JT6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tlcd1Q99JT6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tlcd1Q99JT6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tlcd1Q99JT6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tlcd1Q99JT6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tlcd1Q99JT6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tlcd1Q99JT6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tlcd1Q99JT6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tlcd1Q99JT6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tlcd1Q99JT6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tlcd1Q99JT6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tlcd1Q99JT6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tlcd1Q99JT6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tlcd1Q99JT6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tlcd1Q99JT6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tlcd1Q99JT6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tlcd1Q99JT6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tlcd1Q99JT6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tlcd1Q99JT6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tlcd1Q99JT6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms