Protein–RNA interactions for Protein: Q99JH7

Clstn3, Calsyntenin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn3Q99JH7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clstn3Q99JH7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Clstn3Q99JH7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Clstn3Q99JH7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Clstn3Q99JH7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clstn3Q99JH7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clstn3Q99JH7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clstn3Q99JH7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clstn3Q99JH7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clstn3Q99JH7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clstn3Q99JH7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Clstn3Q99JH7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clstn3Q99JH7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clstn3Q99JH7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clstn3Q99JH7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clstn3Q99JH7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clstn3Q99JH7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clstn3Q99JH7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clstn3Q99JH7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clstn3Q99JH7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clstn3Q99JH7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Clstn3Q99JH7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Clstn3Q99JH7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clstn3Q99JH7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clstn3Q99JH7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clstn3Q99JH7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clstn3Q99JH7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clstn3Q99JH7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clstn3Q99JH7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clstn3Q99JH7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clstn3Q99JH7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clstn3Q99JH7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clstn3Q99JH7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clstn3Q99JH7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clstn3Q99JH7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clstn3Q99JH7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clstn3Q99JH7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clstn3Q99JH7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clstn3Q99JH7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clstn3Q99JH7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clstn3Q99JH7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Clstn3Q99JH7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clstn3Q99JH7 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clstn3Q99JH7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clstn3Q99JH7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clstn3Q99JH7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clstn3Q99JH7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clstn3Q99JH7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Clstn3Q99JH7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clstn3Q99JH7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clstn3Q99JH7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clstn3Q99JH7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clstn3Q99JH7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clstn3Q99JH7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clstn3Q99JH7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Clstn3Q99JH7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clstn3Q99JH7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clstn3Q99JH7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Clstn3Q99JH7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Clstn3Q99JH7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clstn3Q99JH7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clstn3Q99JH7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clstn3Q99JH7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clstn3Q99JH7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Clstn3Q99JH7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clstn3Q99JH7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clstn3Q99JH7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clstn3Q99JH7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clstn3Q99JH7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clstn3Q99JH7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clstn3Q99JH7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clstn3Q99JH7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clstn3Q99JH7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clstn3Q99JH7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clstn3Q99JH7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clstn3Q99JH7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clstn3Q99JH7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clstn3Q99JH7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clstn3Q99JH7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clstn3Q99JH7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clstn3Q99JH7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clstn3Q99JH7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clstn3Q99JH7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clstn3Q99JH7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clstn3Q99JH7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clstn3Q99JH7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clstn3Q99JH7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clstn3Q99JH7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clstn3Q99JH7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clstn3Q99JH7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Clstn3Q99JH7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clstn3Q99JH7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clstn3Q99JH7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Clstn3Q99JH7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clstn3Q99JH7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clstn3Q99JH7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clstn3Q99JH7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clstn3Q99JH7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clstn3Q99JH7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clstn3Q99JH7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms