Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pacsin3Q99JB8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pacsin3Q99JB8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Pacsin3Q99JB8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pacsin3Q99JB8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pacsin3Q99JB8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pacsin3Q99JB8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pacsin3Q99JB8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pacsin3Q99JB8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pacsin3Q99JB8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pacsin3Q99JB8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pacsin3Q99JB8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pacsin3Q99JB8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pacsin3Q99JB8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pacsin3Q99JB8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Pacsin3Q99JB8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pacsin3Q99JB8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pacsin3Q99JB8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pacsin3Q99JB8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pacsin3Q99JB8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pacsin3Q99JB8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pacsin3Q99JB8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pacsin3Q99JB8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pacsin3Q99JB8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pacsin3Q99JB8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pacsin3Q99JB8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pacsin3Q99JB8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pacsin3Q99JB8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pacsin3Q99JB8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pacsin3Q99JB8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pacsin3Q99JB8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pacsin3Q99JB8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pacsin3Q99JB8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pacsin3Q99JB8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pacsin3Q99JB8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pacsin3Q99JB8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pacsin3Q99JB8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pacsin3Q99JB8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pacsin3Q99JB8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pacsin3Q99JB8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pacsin3Q99JB8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pacsin3Q99JB8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pacsin3Q99JB8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pacsin3Q99JB8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pacsin3Q99JB8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pacsin3Q99JB8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pacsin3Q99JB8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pacsin3Q99JB8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Pacsin3Q99JB8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pacsin3Q99JB8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pacsin3Q99JB8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pacsin3Q99JB8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pacsin3Q99JB8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pacsin3Q99JB8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Pacsin3Q99JB8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pacsin3Q99JB8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pacsin3Q99JB8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pacsin3Q99JB8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pacsin3Q99JB8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pacsin3Q99JB8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pacsin3Q99JB8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pacsin3Q99JB8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pacsin3Q99JB8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pacsin3Q99JB8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pacsin3Q99JB8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pacsin3Q99JB8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pacsin3Q99JB8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pacsin3Q99JB8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pacsin3Q99JB8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pacsin3Q99JB8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pacsin3Q99JB8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pacsin3Q99JB8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pacsin3Q99JB8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pacsin3Q99JB8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pacsin3Q99JB8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pacsin3Q99JB8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pacsin3Q99JB8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pacsin3Q99JB8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pacsin3Q99JB8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pacsin3Q99JB8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pacsin3Q99JB8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Pacsin3Q99JB8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pacsin3Q99JB8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pacsin3Q99JB8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pacsin3Q99JB8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pacsin3Q99JB8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pacsin3Q99JB8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pacsin3Q99JB8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pacsin3Q99JB8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pacsin3Q99JB8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pacsin3Q99JB8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pacsin3Q99JB8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Pacsin3Q99JB8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Pacsin3Q99JB8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pacsin3Q99JB8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Pacsin3Q99JB8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pacsin3Q99JB8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pacsin3Q99JB8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pacsin3Q99JB8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pacsin3Q99JB8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms