Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc8b1Q925Q3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc8b1Q925Q3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc8b1Q925Q3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc8b1Q925Q3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc8b1Q925Q3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc8b1Q925Q3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc8b1Q925Q3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc8b1Q925Q3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc8b1Q925Q3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc8b1Q925Q3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc8b1Q925Q3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc8b1Q925Q3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc8b1Q925Q3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc8b1Q925Q3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc8b1Q925Q3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc8b1Q925Q3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc8b1Q925Q3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc8b1Q925Q3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc8b1Q925Q3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc8b1Q925Q3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc8b1Q925Q3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc8b1Q925Q3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc8b1Q925Q3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc8b1Q925Q3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc8b1Q925Q3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc8b1Q925Q3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc8b1Q925Q3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc8b1Q925Q3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc8b1Q925Q3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc8b1Q925Q3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc8b1Q925Q3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc8b1Q925Q3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc8b1Q925Q3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc8b1Q925Q3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc8b1Q925Q3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc8b1Q925Q3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc8b1Q925Q3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc8b1Q925Q3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc8b1Q925Q3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc8b1Q925Q3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc8b1Q925Q3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc8b1Q925Q3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc8b1Q925Q3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc8b1Q925Q3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc8b1Q925Q3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc8b1Q925Q3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc8b1Q925Q3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc8b1Q925Q3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc8b1Q925Q3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc8b1Q925Q3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc8b1Q925Q3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc8b1Q925Q3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc8b1Q925Q3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc8b1Q925Q3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Slc8b1Q925Q3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc8b1Q925Q3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc8b1Q925Q3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc8b1Q925Q3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc8b1Q925Q3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc8b1Q925Q3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc8b1Q925Q3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc8b1Q925Q3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc8b1Q925Q3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc8b1Q925Q3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc8b1Q925Q3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc8b1Q925Q3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc8b1Q925Q3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc8b1Q925Q3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc8b1Q925Q3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc8b1Q925Q3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc8b1Q925Q3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc8b1Q925Q3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc8b1Q925Q3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slc8b1Q925Q3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slc8b1Q925Q3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slc8b1Q925Q3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slc8b1Q925Q3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Slc8b1Q925Q3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slc8b1Q925Q3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slc8b1Q925Q3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slc8b1Q925Q3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc8b1Q925Q3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc8b1Q925Q3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc8b1Q925Q3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc8b1Q925Q3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc8b1Q925Q3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc8b1Q925Q3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc8b1Q925Q3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc8b1Q925Q3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc8b1Q925Q3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc8b1Q925Q3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc8b1Q925Q3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc8b1Q925Q3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc8b1Q925Q3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc8b1Q925Q3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc8b1Q925Q3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc8b1Q925Q3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc8b1Q925Q3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc8b1Q925Q3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms