Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn16Q925N4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn16Q925N4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn16Q925N4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn16Q925N4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn16Q925N4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn16Q925N4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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