Protein–RNA interactions for Protein: Q924L1

Letmd1, LETM1 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Letmd1Q924L1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Letmd1Q924L1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Letmd1Q924L1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Letmd1Q924L1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Letmd1Q924L1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Letmd1Q924L1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Letmd1Q924L1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Letmd1Q924L1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Letmd1Q924L1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Letmd1Q924L1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Letmd1Q924L1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Letmd1Q924L1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Letmd1Q924L1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Letmd1Q924L1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Letmd1Q924L1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Letmd1Q924L1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Letmd1Q924L1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Letmd1Q924L1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Letmd1Q924L1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Letmd1Q924L1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Letmd1Q924L1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Letmd1Q924L1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Letmd1Q924L1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Letmd1Q924L1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Letmd1Q924L1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Letmd1Q924L1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Letmd1Q924L1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Letmd1Q924L1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Letmd1Q924L1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Letmd1Q924L1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Letmd1Q924L1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Letmd1Q924L1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Letmd1Q924L1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Letmd1Q924L1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Letmd1Q924L1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Letmd1Q924L1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Letmd1Q924L1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Letmd1Q924L1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Letmd1Q924L1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Letmd1Q924L1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Letmd1Q924L1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Letmd1Q924L1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Letmd1Q924L1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Letmd1Q924L1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Letmd1Q924L1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Letmd1Q924L1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Letmd1Q924L1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Letmd1Q924L1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Letmd1Q924L1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Letmd1Q924L1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Letmd1Q924L1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Letmd1Q924L1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Letmd1Q924L1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Letmd1Q924L1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Letmd1Q924L1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Letmd1Q924L1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Letmd1Q924L1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Letmd1Q924L1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Letmd1Q924L1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Letmd1Q924L1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Letmd1Q924L1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Letmd1Q924L1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Letmd1Q924L1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Letmd1Q924L1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Letmd1Q924L1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Letmd1Q924L1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Letmd1Q924L1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Letmd1Q924L1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Letmd1Q924L1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Letmd1Q924L1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Letmd1Q924L1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Letmd1Q924L1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Letmd1Q924L1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Letmd1Q924L1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Letmd1Q924L1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Letmd1Q924L1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Letmd1Q924L1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Letmd1Q924L1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Letmd1Q924L1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Letmd1Q924L1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Letmd1Q924L1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Letmd1Q924L1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Letmd1Q924L1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Letmd1Q924L1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Letmd1Q924L1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Letmd1Q924L1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Letmd1Q924L1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Letmd1Q924L1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Letmd1Q924L1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Letmd1Q924L1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Letmd1Q924L1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Letmd1Q924L1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Letmd1Q924L1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Letmd1Q924L1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Letmd1Q924L1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Letmd1Q924L1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Letmd1Q924L1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Letmd1Q924L1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Letmd1Q924L1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Letmd1Q924L1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms