Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim59Q922Y2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim59Q922Y2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim59Q922Y2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim59Q922Y2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim59Q922Y2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim59Q922Y2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim59Q922Y2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim59Q922Y2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim59Q922Y2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim59Q922Y2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim59Q922Y2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim59Q922Y2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim59Q922Y2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim59Q922Y2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim59Q922Y2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim59Q922Y2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim59Q922Y2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim59Q922Y2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim59Q922Y2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim59Q922Y2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim59Q922Y2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim59Q922Y2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim59Q922Y2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim59Q922Y2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim59Q922Y2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim59Q922Y2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim59Q922Y2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim59Q922Y2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim59Q922Y2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim59Q922Y2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim59Q922Y2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim59Q922Y2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim59Q922Y2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim59Q922Y2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim59Q922Y2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim59Q922Y2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim59Q922Y2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim59Q922Y2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim59Q922Y2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim59Q922Y2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim59Q922Y2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim59Q922Y2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim59Q922Y2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim59Q922Y2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim59Q922Y2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim59Q922Y2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim59Q922Y2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim59Q922Y2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim59Q922Y2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim59Q922Y2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim59Q922Y2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim59Q922Y2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim59Q922Y2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim59Q922Y2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim59Q922Y2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim59Q922Y2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim59Q922Y2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim59Q922Y2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim59Q922Y2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim59Q922Y2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim59Q922Y2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim59Q922Y2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim59Q922Y2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim59Q922Y2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim59Q922Y2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim59Q922Y2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim59Q922Y2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim59Q922Y2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim59Q922Y2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim59Q922Y2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim59Q922Y2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim59Q922Y2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim59Q922Y2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim59Q922Y2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim59Q922Y2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim59Q922Y2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim59Q922Y2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim59Q922Y2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim59Q922Y2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim59Q922Y2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim59Q922Y2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim59Q922Y2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim59Q922Y2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim59Q922Y2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim59Q922Y2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim59Q922Y2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim59Q922Y2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim59Q922Y2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim59Q922Y2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim59Q922Y2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim59Q922Y2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim59Q922Y2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim59Q922Y2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim59Q922Y2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim59Q922Y2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim59Q922Y2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim59Q922Y2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim59Q922Y2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim59Q922Y2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms