Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y1

Ubxn1, UBX domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn1Q922Y1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubxn1Q922Y1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubxn1Q922Y1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubxn1Q922Y1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubxn1Q922Y1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubxn1Q922Y1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubxn1Q922Y1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubxn1Q922Y1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubxn1Q922Y1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubxn1Q922Y1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubxn1Q922Y1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubxn1Q922Y1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubxn1Q922Y1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubxn1Q922Y1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubxn1Q922Y1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubxn1Q922Y1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubxn1Q922Y1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubxn1Q922Y1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubxn1Q922Y1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubxn1Q922Y1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubxn1Q922Y1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn1Q922Y1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn1Q922Y1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn1Q922Y1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn1Q922Y1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn1Q922Y1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn1Q922Y1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn1Q922Y1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn1Q922Y1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn1Q922Y1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn1Q922Y1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn1Q922Y1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn1Q922Y1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn1Q922Y1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubxn1Q922Y1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubxn1Q922Y1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubxn1Q922Y1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubxn1Q922Y1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubxn1Q922Y1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn1Q922Y1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn1Q922Y1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn1Q922Y1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn1Q922Y1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn1Q922Y1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn1Q922Y1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn1Q922Y1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn1Q922Y1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn1Q922Y1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn1Q922Y1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubxn1Q922Y1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubxn1Q922Y1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubxn1Q922Y1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubxn1Q922Y1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ubxn1Q922Y1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ubxn1Q922Y1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ubxn1Q922Y1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ubxn1Q922Y1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ubxn1Q922Y1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ubxn1Q922Y1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ubxn1Q922Y1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubxn1Q922Y1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubxn1Q922Y1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ubxn1Q922Y1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubxn1Q922Y1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubxn1Q922Y1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubxn1Q922Y1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubxn1Q922Y1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubxn1Q922Y1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubxn1Q922Y1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubxn1Q922Y1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubxn1Q922Y1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ubxn1Q922Y1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubxn1Q922Y1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubxn1Q922Y1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubxn1Q922Y1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubxn1Q922Y1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubxn1Q922Y1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubxn1Q922Y1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubxn1Q922Y1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubxn1Q922Y1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ubxn1Q922Y1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubxn1Q922Y1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubxn1Q922Y1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubxn1Q922Y1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubxn1Q922Y1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubxn1Q922Y1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ubxn1Q922Y1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubxn1Q922Y1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubxn1Q922Y1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubxn1Q922Y1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ubxn1Q922Y1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubxn1Q922Y1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubxn1Q922Y1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubxn1Q922Y1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubxn1Q922Y1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ubxn1Q922Y1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ubxn1Q922Y1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ubxn1Q922Y1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ubxn1Q922Y1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ubxn1Q922Y1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms