Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Afg3l1Q920A7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Afg3l1Q920A7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Afg3l1Q920A7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Afg3l1Q920A7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Afg3l1Q920A7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Afg3l1Q920A7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Afg3l1Q920A7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Afg3l1Q920A7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Afg3l1Q920A7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Afg3l1Q920A7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Afg3l1Q920A7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Afg3l1Q920A7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Afg3l1Q920A7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Afg3l1Q920A7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Afg3l1Q920A7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Afg3l1Q920A7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Afg3l1Q920A7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Afg3l1Q920A7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Afg3l1Q920A7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Afg3l1Q920A7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Afg3l1Q920A7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Afg3l1Q920A7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Afg3l1Q920A7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Afg3l1Q920A7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Afg3l1Q920A7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Afg3l1Q920A7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Afg3l1Q920A7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Afg3l1Q920A7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Afg3l1Q920A7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Afg3l1Q920A7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Afg3l1Q920A7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Afg3l1Q920A7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Afg3l1Q920A7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Afg3l1Q920A7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Afg3l1Q920A7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Afg3l1Q920A7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Afg3l1Q920A7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Afg3l1Q920A7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Afg3l1Q920A7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Afg3l1Q920A7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Afg3l1Q920A7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Afg3l1Q920A7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Afg3l1Q920A7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Afg3l1Q920A7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Afg3l1Q920A7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Afg3l1Q920A7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Afg3l1Q920A7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Afg3l1Q920A7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Afg3l1Q920A7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Afg3l1Q920A7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Afg3l1Q920A7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Afg3l1Q920A7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Afg3l1Q920A7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Afg3l1Q920A7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Afg3l1Q920A7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Afg3l1Q920A7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Afg3l1Q920A7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Afg3l1Q920A7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Afg3l1Q920A7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Afg3l1Q920A7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Afg3l1Q920A7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Afg3l1Q920A7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Afg3l1Q920A7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Afg3l1Q920A7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Afg3l1Q920A7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Afg3l1Q920A7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Afg3l1Q920A7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Afg3l1Q920A7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Afg3l1Q920A7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Afg3l1Q920A7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Afg3l1Q920A7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Afg3l1Q920A7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Afg3l1Q920A7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Afg3l1Q920A7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Afg3l1Q920A7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Afg3l1Q920A7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Afg3l1Q920A7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Afg3l1Q920A7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Afg3l1Q920A7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Afg3l1Q920A7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Afg3l1Q920A7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Afg3l1Q920A7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Afg3l1Q920A7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Afg3l1Q920A7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Afg3l1Q920A7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Afg3l1Q920A7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Afg3l1Q920A7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Afg3l1Q920A7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Afg3l1Q920A7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Afg3l1Q920A7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Afg3l1Q920A7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Afg3l1Q920A7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Afg3l1Q920A7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Afg3l1Q920A7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Afg3l1Q920A7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Afg3l1Q920A7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Afg3l1Q920A7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Afg3l1Q920A7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Afg3l1Q920A7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
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