Protein–RNA interactions for Protein: Q91YJ2

Snx4, Sorting nexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx4Q91YJ2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snx4Q91YJ2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snx4Q91YJ2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snx4Q91YJ2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Snx4Q91YJ2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snx4Q91YJ2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Snx4Q91YJ2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Snx4Q91YJ2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Snx4Q91YJ2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Snx4Q91YJ2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snx4Q91YJ2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snx4Q91YJ2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snx4Q91YJ2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snx4Q91YJ2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snx4Q91YJ2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snx4Q91YJ2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snx4Q91YJ2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snx4Q91YJ2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snx4Q91YJ2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snx4Q91YJ2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Snx4Q91YJ2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx4Q91YJ2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx4Q91YJ2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx4Q91YJ2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx4Q91YJ2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx4Q91YJ2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx4Q91YJ2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx4Q91YJ2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx4Q91YJ2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx4Q91YJ2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Snx4Q91YJ2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx4Q91YJ2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx4Q91YJ2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx4Q91YJ2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx4Q91YJ2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx4Q91YJ2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx4Q91YJ2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx4Q91YJ2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx4Q91YJ2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx4Q91YJ2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx4Q91YJ2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx4Q91YJ2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx4Q91YJ2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx4Q91YJ2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx4Q91YJ2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx4Q91YJ2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx4Q91YJ2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx4Q91YJ2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx4Q91YJ2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx4Q91YJ2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx4Q91YJ2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx4Q91YJ2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx4Q91YJ2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx4Q91YJ2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx4Q91YJ2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx4Q91YJ2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx4Q91YJ2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx4Q91YJ2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx4Q91YJ2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx4Q91YJ2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx4Q91YJ2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx4Q91YJ2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx4Q91YJ2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx4Q91YJ2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx4Q91YJ2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx4Q91YJ2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx4Q91YJ2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx4Q91YJ2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx4Q91YJ2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx4Q91YJ2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx4Q91YJ2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx4Q91YJ2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx4Q91YJ2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx4Q91YJ2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx4Q91YJ2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx4Q91YJ2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx4Q91YJ2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx4Q91YJ2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx4Q91YJ2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx4Q91YJ2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx4Q91YJ2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx4Q91YJ2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx4Q91YJ2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx4Q91YJ2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx4Q91YJ2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx4Q91YJ2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx4Q91YJ2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx4Q91YJ2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx4Q91YJ2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx4Q91YJ2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx4Q91YJ2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx4Q91YJ2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx4Q91YJ2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx4Q91YJ2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx4Q91YJ2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx4Q91YJ2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx4Q91YJ2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx4Q91YJ2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx4Q91YJ2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx4Q91YJ2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms