Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y63

Slc13a3, Solute carrier family 13 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc13a3Q91Y63 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc13a3Q91Y63 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc13a3Q91Y63 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc13a3Q91Y63 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc13a3Q91Y63 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc13a3Q91Y63 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc13a3Q91Y63 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc13a3Q91Y63 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc13a3Q91Y63 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc13a3Q91Y63 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc13a3Q91Y63 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc13a3Q91Y63 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc13a3Q91Y63 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc13a3Q91Y63 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc13a3Q91Y63 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc13a3Q91Y63 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc13a3Q91Y63 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc13a3Q91Y63 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc13a3Q91Y63 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc13a3Q91Y63 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc13a3Q91Y63 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc13a3Q91Y63 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc13a3Q91Y63 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc13a3Q91Y63 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc13a3Q91Y63 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc13a3Q91Y63 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc13a3Q91Y63 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc13a3Q91Y63 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc13a3Q91Y63 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc13a3Q91Y63 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc13a3Q91Y63 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc13a3Q91Y63 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc13a3Q91Y63 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc13a3Q91Y63 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc13a3Q91Y63 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc13a3Q91Y63 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc13a3Q91Y63 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc13a3Q91Y63 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc13a3Q91Y63 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc13a3Q91Y63 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc13a3Q91Y63 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc13a3Q91Y63 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Slc13a3Q91Y63 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc13a3Q91Y63 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc13a3Q91Y63 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc13a3Q91Y63 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc13a3Q91Y63 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc13a3Q91Y63 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc13a3Q91Y63 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc13a3Q91Y63 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc13a3Q91Y63 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc13a3Q91Y63 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc13a3Q91Y63 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc13a3Q91Y63 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc13a3Q91Y63 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc13a3Q91Y63 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc13a3Q91Y63 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc13a3Q91Y63 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc13a3Q91Y63 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc13a3Q91Y63 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc13a3Q91Y63 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc13a3Q91Y63 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc13a3Q91Y63 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc13a3Q91Y63 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc13a3Q91Y63 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc13a3Q91Y63 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc13a3Q91Y63 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc13a3Q91Y63 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc13a3Q91Y63 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc13a3Q91Y63 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc13a3Q91Y63 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc13a3Q91Y63 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc13a3Q91Y63 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc13a3Q91Y63 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc13a3Q91Y63 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc13a3Q91Y63 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc13a3Q91Y63 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc13a3Q91Y63 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc13a3Q91Y63 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc13a3Q91Y63 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc13a3Q91Y63 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc13a3Q91Y63 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc13a3Q91Y63 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc13a3Q91Y63 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Slc13a3Q91Y63 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc13a3Q91Y63 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc13a3Q91Y63 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc13a3Q91Y63 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc13a3Q91Y63 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc13a3Q91Y63 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc13a3Q91Y63 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc13a3Q91Y63 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc13a3Q91Y63 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc13a3Q91Y63 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc13a3Q91Y63 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc13a3Q91Y63 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Slc13a3Q91Y63 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc13a3Q91Y63 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Slc13a3Q91Y63 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc13a3Q91Y63 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms