Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y13

Pcdha7, Protocadherin alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha7Q91Y13 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdha7Q91Y13 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdha7Q91Y13 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdha7Q91Y13 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdha7Q91Y13 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdha7Q91Y13 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdha7Q91Y13 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdha7Q91Y13 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdha7Q91Y13 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdha7Q91Y13 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdha7Q91Y13 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdha7Q91Y13 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdha7Q91Y13 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdha7Q91Y13 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcdha7Q91Y13 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pcdha7Q91Y13 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdha7Q91Y13 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdha7Q91Y13 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdha7Q91Y13 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdha7Q91Y13 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdha7Q91Y13 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdha7Q91Y13 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcdha7Q91Y13 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdha7Q91Y13 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdha7Q91Y13 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdha7Q91Y13 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdha7Q91Y13 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdha7Q91Y13 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdha7Q91Y13 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdha7Q91Y13 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdha7Q91Y13 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdha7Q91Y13 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdha7Q91Y13 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdha7Q91Y13 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdha7Q91Y13 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdha7Q91Y13 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcdha7Q91Y13 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdha7Q91Y13 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdha7Q91Y13 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdha7Q91Y13 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdha7Q91Y13 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcdha7Q91Y13 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdha7Q91Y13 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdha7Q91Y13 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdha7Q91Y13 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdha7Q91Y13 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdha7Q91Y13 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdha7Q91Y13 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdha7Q91Y13 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcdha7Q91Y13 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdha7Q91Y13 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdha7Q91Y13 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdha7Q91Y13 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcdha7Q91Y13 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdha7Q91Y13 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdha7Q91Y13 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdha7Q91Y13 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdha7Q91Y13 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdha7Q91Y13 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdha7Q91Y13 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pcdha7Q91Y13 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pcdha7Q91Y13 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pcdha7Q91Y13 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pcdha7Q91Y13 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pcdha7Q91Y13 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdha7Q91Y13 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdha7Q91Y13 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdha7Q91Y13 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdha7Q91Y13 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdha7Q91Y13 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdha7Q91Y13 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdha7Q91Y13 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdha7Q91Y13 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdha7Q91Y13 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdha7Q91Y13 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdha7Q91Y13 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdha7Q91Y13 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdha7Q91Y13 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdha7Q91Y13 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdha7Q91Y13 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdha7Q91Y13 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdha7Q91Y13 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdha7Q91Y13 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdha7Q91Y13 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdha7Q91Y13 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdha7Q91Y13 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdha7Q91Y13 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdha7Q91Y13 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdha7Q91Y13 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdha7Q91Y13 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdha7Q91Y13 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdha7Q91Y13 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdha7Q91Y13 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdha7Q91Y13 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdha7Q91Y13 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdha7Q91Y13 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdha7Q91Y13 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdha7Q91Y13 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdha7Q91Y13 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdha7Q91Y13 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms