Protein–RNA interactions for Protein: Q91WG3

Trub2, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Trub2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trub2Q91WG3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Trub2Q91WG3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trub2Q91WG3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trub2Q91WG3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trub2Q91WG3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trub2Q91WG3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trub2Q91WG3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trub2Q91WG3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trub2Q91WG3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trub2Q91WG3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trub2Q91WG3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trub2Q91WG3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trub2Q91WG3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trub2Q91WG3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trub2Q91WG3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trub2Q91WG3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trub2Q91WG3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trub2Q91WG3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trub2Q91WG3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trub2Q91WG3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trub2Q91WG3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trub2Q91WG3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trub2Q91WG3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trub2Q91WG3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trub2Q91WG3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trub2Q91WG3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trub2Q91WG3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trub2Q91WG3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trub2Q91WG3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trub2Q91WG3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trub2Q91WG3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trub2Q91WG3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trub2Q91WG3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Trub2Q91WG3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Trub2Q91WG3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trub2Q91WG3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trub2Q91WG3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trub2Q91WG3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trub2Q91WG3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trub2Q91WG3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trub2Q91WG3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trub2Q91WG3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trub2Q91WG3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trub2Q91WG3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trub2Q91WG3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trub2Q91WG3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trub2Q91WG3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trub2Q91WG3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trub2Q91WG3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trub2Q91WG3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trub2Q91WG3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Trub2Q91WG3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Trub2Q91WG3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trub2Q91WG3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trub2Q91WG3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trub2Q91WG3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trub2Q91WG3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trub2Q91WG3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trub2Q91WG3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trub2Q91WG3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trub2Q91WG3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trub2Q91WG3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trub2Q91WG3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trub2Q91WG3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trub2Q91WG3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trub2Q91WG3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Trub2Q91WG3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trub2Q91WG3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trub2Q91WG3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trub2Q91WG3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trub2Q91WG3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trub2Q91WG3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trub2Q91WG3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trub2Q91WG3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trub2Q91WG3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trub2Q91WG3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trub2Q91WG3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trub2Q91WG3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trub2Q91WG3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trub2Q91WG3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trub2Q91WG3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trub2Q91WG3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trub2Q91WG3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trub2Q91WG3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trub2Q91WG3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trub2Q91WG3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trub2Q91WG3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trub2Q91WG3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trub2Q91WG3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trub2Q91WG3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trub2Q91WG3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trub2Q91WG3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trub2Q91WG3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trub2Q91WG3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trub2Q91WG3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trub2Q91WG3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trub2Q91WG3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trub2Q91WG3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trub2Q91WG3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trub2Q91WG3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms