Protein–RNA interactions for Protein: Q91W82

Ube2e2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e2Q91W82 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2e2Q91W82 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2e2Q91W82 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2e2Q91W82 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2e2Q91W82 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2e2Q91W82 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2e2Q91W82 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ube2e2Q91W82 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2e2Q91W82 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2e2Q91W82 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2e2Q91W82 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2e2Q91W82 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2e2Q91W82 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2e2Q91W82 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2e2Q91W82 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2e2Q91W82 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2e2Q91W82 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2e2Q91W82 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2e2Q91W82 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ube2e2Q91W82 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2e2Q91W82 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2e2Q91W82 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2e2Q91W82 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2e2Q91W82 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ube2e2Q91W82 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2e2Q91W82 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2e2Q91W82 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2e2Q91W82 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2e2Q91W82 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2e2Q91W82 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2e2Q91W82 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2e2Q91W82 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ube2e2Q91W82 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2e2Q91W82 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2e2Q91W82 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2e2Q91W82 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2e2Q91W82 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2e2Q91W82 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2e2Q91W82 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2e2Q91W82 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2e2Q91W82 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2e2Q91W82 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2e2Q91W82 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2e2Q91W82 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2e2Q91W82 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2e2Q91W82 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ube2e2Q91W82 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2e2Q91W82 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2e2Q91W82 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2e2Q91W82 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2e2Q91W82 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2e2Q91W82 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2e2Q91W82 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2e2Q91W82 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2e2Q91W82 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2e2Q91W82 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2e2Q91W82 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2e2Q91W82 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2e2Q91W82 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ube2e2Q91W82 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2e2Q91W82 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2e2Q91W82 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2e2Q91W82 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2e2Q91W82 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2e2Q91W82 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2e2Q91W82 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2e2Q91W82 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2e2Q91W82 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2e2Q91W82 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2e2Q91W82 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2e2Q91W82 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2e2Q91W82 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2e2Q91W82 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2e2Q91W82 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2e2Q91W82 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2e2Q91W82 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2e2Q91W82 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ube2e2Q91W82 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2e2Q91W82 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2e2Q91W82 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2e2Q91W82 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2e2Q91W82 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2e2Q91W82 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2e2Q91W82 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2e2Q91W82 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2e2Q91W82 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2e2Q91W82 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2e2Q91W82 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2e2Q91W82 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2e2Q91W82 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ube2e2Q91W82 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2e2Q91W82 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2e2Q91W82 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2e2Q91W82 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2e2Q91W82 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2e2Q91W82 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2e2Q91W82 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2e2Q91W82 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2e2Q91W82 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ube2e2Q91W82 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms