Protein–RNA interactions for Protein: Q91W67

Ubl7, Ubiquitin-like protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl7Q91W67 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ubl7Q91W67 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ubl7Q91W67 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ubl7Q91W67 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ubl7Q91W67 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ubl7Q91W67 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ubl7Q91W67 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ubl7Q91W67 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ubl7Q91W67 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ubl7Q91W67 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubl7Q91W67 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubl7Q91W67 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubl7Q91W67 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubl7Q91W67 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubl7Q91W67 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubl7Q91W67 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubl7Q91W67 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubl7Q91W67 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubl7Q91W67 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ubl7Q91W67 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubl7Q91W67 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubl7Q91W67 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubl7Q91W67 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubl7Q91W67 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubl7Q91W67 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubl7Q91W67 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubl7Q91W67 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubl7Q91W67 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubl7Q91W67 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubl7Q91W67 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubl7Q91W67 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubl7Q91W67 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubl7Q91W67 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubl7Q91W67 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubl7Q91W67 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubl7Q91W67 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubl7Q91W67 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubl7Q91W67 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubl7Q91W67 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubl7Q91W67 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubl7Q91W67 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubl7Q91W67 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubl7Q91W67 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubl7Q91W67 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ubl7Q91W67 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ubl7Q91W67 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ubl7Q91W67 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ubl7Q91W67 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ubl7Q91W67 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ubl7Q91W67 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ubl7Q91W67 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ubl7Q91W67 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ubl7Q91W67 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ubl7Q91W67 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ubl7Q91W67 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ubl7Q91W67 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubl7Q91W67 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubl7Q91W67 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubl7Q91W67 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubl7Q91W67 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubl7Q91W67 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubl7Q91W67 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubl7Q91W67 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubl7Q91W67 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubl7Q91W67 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubl7Q91W67 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubl7Q91W67 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubl7Q91W67 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubl7Q91W67 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubl7Q91W67 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubl7Q91W67 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubl7Q91W67 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubl7Q91W67 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubl7Q91W67 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubl7Q91W67 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubl7Q91W67 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubl7Q91W67 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubl7Q91W67 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ubl7Q91W67 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ubl7Q91W67 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ubl7Q91W67 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ubl7Q91W67 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ubl7Q91W67 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ubl7Q91W67 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ubl7Q91W67 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubl7Q91W67 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubl7Q91W67 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubl7Q91W67 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubl7Q91W67 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ubl7Q91W67 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ubl7Q91W67 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ubl7Q91W67 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ubl7Q91W67 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ubl7Q91W67 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ubl7Q91W67 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ubl7Q91W67 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ubl7Q91W67 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ubl7Q91W67 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ubl7Q91W67 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ubl7Q91W67 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms