Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIG1

Rest, RE1-silencing transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RestQ8VIG1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RestQ8VIG1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RestQ8VIG1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RestQ8VIG1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RestQ8VIG1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RestQ8VIG1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RestQ8VIG1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RestQ8VIG1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RestQ8VIG1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RestQ8VIG1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RestQ8VIG1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RestQ8VIG1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RestQ8VIG1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RestQ8VIG1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RestQ8VIG1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RestQ8VIG1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RestQ8VIG1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RestQ8VIG1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RestQ8VIG1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RestQ8VIG1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RestQ8VIG1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RestQ8VIG1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RestQ8VIG1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RestQ8VIG1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RestQ8VIG1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RestQ8VIG1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RestQ8VIG1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RestQ8VIG1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RestQ8VIG1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RestQ8VIG1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RestQ8VIG1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RestQ8VIG1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RestQ8VIG1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RestQ8VIG1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RestQ8VIG1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RestQ8VIG1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RestQ8VIG1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RestQ8VIG1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RestQ8VIG1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RestQ8VIG1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RestQ8VIG1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RestQ8VIG1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RestQ8VIG1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RestQ8VIG1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RestQ8VIG1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RestQ8VIG1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RestQ8VIG1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RestQ8VIG1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RestQ8VIG1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RestQ8VIG1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RestQ8VIG1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RestQ8VIG1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RestQ8VIG1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RestQ8VIG1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RestQ8VIG1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RestQ8VIG1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RestQ8VIG1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RestQ8VIG1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RestQ8VIG1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RestQ8VIG1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RestQ8VIG1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RestQ8VIG1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RestQ8VIG1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RestQ8VIG1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RestQ8VIG1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RestQ8VIG1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RestQ8VIG1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RestQ8VIG1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RestQ8VIG1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RestQ8VIG1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RestQ8VIG1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RestQ8VIG1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RestQ8VIG1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RestQ8VIG1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RestQ8VIG1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RestQ8VIG1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RestQ8VIG1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RestQ8VIG1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RestQ8VIG1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RestQ8VIG1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RestQ8VIG1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RestQ8VIG1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RestQ8VIG1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RestQ8VIG1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RestQ8VIG1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RestQ8VIG1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RestQ8VIG1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RestQ8VIG1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RestQ8VIG1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RestQ8VIG1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RestQ8VIG1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RestQ8VIG1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RestQ8VIG1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RestQ8VIG1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RestQ8VIG1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RestQ8VIG1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RestQ8VIG1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RestQ8VIG1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RestQ8VIG1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RestQ8VIG1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms