Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHS2

Crb1, Protein crumbs homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crb1Q8VHS2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Crb1Q8VHS2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Crb1Q8VHS2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Crb1Q8VHS2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Crb1Q8VHS2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Crb1Q8VHS2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Crb1Q8VHS2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Crb1Q8VHS2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Crb1Q8VHS2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Crb1Q8VHS2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Crb1Q8VHS2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Crb1Q8VHS2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Crb1Q8VHS2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Crb1Q8VHS2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Crb1Q8VHS2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Crb1Q8VHS2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Crb1Q8VHS2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Crb1Q8VHS2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Crb1Q8VHS2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Crb1Q8VHS2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Crb1Q8VHS2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Crb1Q8VHS2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Crb1Q8VHS2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Crb1Q8VHS2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Crb1Q8VHS2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Crb1Q8VHS2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Crb1Q8VHS2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Crb1Q8VHS2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Crb1Q8VHS2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Crb1Q8VHS2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Crb1Q8VHS2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Crb1Q8VHS2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Crb1Q8VHS2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Crb1Q8VHS2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Crb1Q8VHS2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Crb1Q8VHS2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Crb1Q8VHS2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Crb1Q8VHS2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Crb1Q8VHS2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Crb1Q8VHS2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Crb1Q8VHS2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Crb1Q8VHS2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Crb1Q8VHS2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Crb1Q8VHS2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Crb1Q8VHS2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Crb1Q8VHS2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Crb1Q8VHS2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Crb1Q8VHS2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Crb1Q8VHS2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Crb1Q8VHS2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Crb1Q8VHS2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Crb1Q8VHS2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Crb1Q8VHS2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Crb1Q8VHS2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Crb1Q8VHS2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Crb1Q8VHS2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Crb1Q8VHS2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Crb1Q8VHS2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Crb1Q8VHS2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Crb1Q8VHS2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Crb1Q8VHS2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Crb1Q8VHS2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Crb1Q8VHS2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Crb1Q8VHS2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Crb1Q8VHS2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Crb1Q8VHS2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Crb1Q8VHS2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Crb1Q8VHS2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Crb1Q8VHS2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Crb1Q8VHS2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Crb1Q8VHS2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Crb1Q8VHS2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Crb1Q8VHS2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Crb1Q8VHS2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Crb1Q8VHS2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Crb1Q8VHS2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Crb1Q8VHS2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Crb1Q8VHS2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Crb1Q8VHS2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Crb1Q8VHS2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Crb1Q8VHS2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Crb1Q8VHS2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Crb1Q8VHS2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Crb1Q8VHS2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Crb1Q8VHS2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Crb1Q8VHS2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Crb1Q8VHS2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Crb1Q8VHS2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Crb1Q8VHS2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Crb1Q8VHS2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Crb1Q8VHS2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Crb1Q8VHS2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Crb1Q8VHS2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Crb1Q8VHS2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Crb1Q8VHS2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Crb1Q8VHS2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Crb1Q8VHS2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Crb1Q8VHS2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Crb1Q8VHS2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Crb1Q8VHS2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms