Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cabp4Q8VHC5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cabp4Q8VHC5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cabp4Q8VHC5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cabp4Q8VHC5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cabp4Q8VHC5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cabp4Q8VHC5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cabp4Q8VHC5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cabp4Q8VHC5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Cabp4Q8VHC5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cabp4Q8VHC5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cabp4Q8VHC5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cabp4Q8VHC5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cabp4Q8VHC5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cabp4Q8VHC5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cabp4Q8VHC5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cabp4Q8VHC5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cabp4Q8VHC5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cabp4Q8VHC5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cabp4Q8VHC5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cabp4Q8VHC5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cabp4Q8VHC5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cabp4Q8VHC5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cabp4Q8VHC5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cabp4Q8VHC5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cabp4Q8VHC5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cabp4Q8VHC5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cabp4Q8VHC5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Cabp4Q8VHC5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cabp4Q8VHC5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cabp4Q8VHC5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cabp4Q8VHC5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cabp4Q8VHC5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cabp4Q8VHC5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cabp4Q8VHC5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cabp4Q8VHC5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cabp4Q8VHC5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cabp4Q8VHC5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cabp4Q8VHC5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cabp4Q8VHC5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cabp4Q8VHC5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cabp4Q8VHC5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cabp4Q8VHC5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Cabp4Q8VHC5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cabp4Q8VHC5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cabp4Q8VHC5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cabp4Q8VHC5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cabp4Q8VHC5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cabp4Q8VHC5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cabp4Q8VHC5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cabp4Q8VHC5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cabp4Q8VHC5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cabp4Q8VHC5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cabp4Q8VHC5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Cabp4Q8VHC5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Cabp4Q8VHC5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cabp4Q8VHC5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Cabp4Q8VHC5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cabp4Q8VHC5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cabp4Q8VHC5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cabp4Q8VHC5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cabp4Q8VHC5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cabp4Q8VHC5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cabp4Q8VHC5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cabp4Q8VHC5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cabp4Q8VHC5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cabp4Q8VHC5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cabp4Q8VHC5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cabp4Q8VHC5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cabp4Q8VHC5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cabp4Q8VHC5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cabp4Q8VHC5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cabp4Q8VHC5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cabp4Q8VHC5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Cabp4Q8VHC5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cabp4Q8VHC5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cabp4Q8VHC5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cabp4Q8VHC5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cabp4Q8VHC5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cabp4Q8VHC5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Cabp4Q8VHC5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cabp4Q8VHC5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Cabp4Q8VHC5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cabp4Q8VHC5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cabp4Q8VHC5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cabp4Q8VHC5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
Cabp4Q8VHC5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cabp4Q8VHC5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cabp4Q8VHC5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cabp4Q8VHC5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cabp4Q8VHC5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cabp4Q8VHC5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cabp4Q8VHC5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cabp4Q8VHC5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cabp4Q8VHC5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cabp4Q8VHC5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cabp4Q8VHC5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cabp4Q8VHC5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cabp4Q8VHC5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cabp4Q8VHC5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms