Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc71Q8VEG0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc71Q8VEG0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc71Q8VEG0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc71Q8VEG0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc71Q8VEG0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc71Q8VEG0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc71Q8VEG0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc71Q8VEG0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc71Q8VEG0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc71Q8VEG0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc71Q8VEG0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc71Q8VEG0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc71Q8VEG0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc71Q8VEG0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc71Q8VEG0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc71Q8VEG0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc71Q8VEG0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc71Q8VEG0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc71Q8VEG0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc71Q8VEG0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc71Q8VEG0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc71Q8VEG0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc71Q8VEG0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc71Q8VEG0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc71Q8VEG0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc71Q8VEG0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc71Q8VEG0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc71Q8VEG0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc71Q8VEG0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc71Q8VEG0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc71Q8VEG0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc71Q8VEG0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc71Q8VEG0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc71Q8VEG0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc71Q8VEG0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc71Q8VEG0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc71Q8VEG0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc71Q8VEG0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc71Q8VEG0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc71Q8VEG0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc71Q8VEG0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc71Q8VEG0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc71Q8VEG0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc71Q8VEG0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc71Q8VEG0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc71Q8VEG0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc71Q8VEG0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc71Q8VEG0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc71Q8VEG0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc71Q8VEG0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc71Q8VEG0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc71Q8VEG0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc71Q8VEG0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc71Q8VEG0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc71Q8VEG0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc71Q8VEG0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc71Q8VEG0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc71Q8VEG0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc71Q8VEG0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc71Q8VEG0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc71Q8VEG0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc71Q8VEG0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc71Q8VEG0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc71Q8VEG0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc71Q8VEG0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc71Q8VEG0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc71Q8VEG0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc71Q8VEG0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc71Q8VEG0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc71Q8VEG0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc71Q8VEG0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc71Q8VEG0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc71Q8VEG0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc71Q8VEG0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc71Q8VEG0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc71Q8VEG0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc71Q8VEG0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc71Q8VEG0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc71Q8VEG0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc71Q8VEG0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc71Q8VEG0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc71Q8VEG0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc71Q8VEG0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc71Q8VEG0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc71Q8VEG0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc71Q8VEG0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc71Q8VEG0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc71Q8VEG0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc71Q8VEG0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc71Q8VEG0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc71Q8VEG0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc71Q8VEG0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc71Q8VEG0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc71Q8VEG0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc71Q8VEG0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc71Q8VEG0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc71Q8VEG0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc71Q8VEG0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc71Q8VEG0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.1 ms