Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE62

Paip1, Polyadenylate-binding protein-interacting protein 1, mousemouse

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Length 400 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paip1Q8VE62 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Paip1Q8VE62 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Paip1Q8VE62 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Paip1Q8VE62 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Paip1Q8VE62 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Paip1Q8VE62 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Paip1Q8VE62 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Paip1Q8VE62 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Paip1Q8VE62 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Paip1Q8VE62 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Paip1Q8VE62 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Paip1Q8VE62 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Paip1Q8VE62 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Paip1Q8VE62 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Paip1Q8VE62 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Paip1Q8VE62 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Paip1Q8VE62 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Paip1Q8VE62 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Paip1Q8VE62 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Paip1Q8VE62 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Paip1Q8VE62 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Paip1Q8VE62 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Paip1Q8VE62 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Paip1Q8VE62 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Paip1Q8VE62 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Paip1Q8VE62 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Paip1Q8VE62 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Paip1Q8VE62 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Paip1Q8VE62 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Paip1Q8VE62 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Paip1Q8VE62 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Paip1Q8VE62 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Paip1Q8VE62 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Paip1Q8VE62 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Paip1Q8VE62 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Paip1Q8VE62 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Paip1Q8VE62 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Paip1Q8VE62 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Paip1Q8VE62 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Paip1Q8VE62 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Paip1Q8VE62 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Paip1Q8VE62 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Paip1Q8VE62 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Paip1Q8VE62 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Paip1Q8VE62 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Paip1Q8VE62 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Paip1Q8VE62 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Paip1Q8VE62 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Paip1Q8VE62 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Paip1Q8VE62 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Paip1Q8VE62 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Paip1Q8VE62 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Paip1Q8VE62 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Paip1Q8VE62 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Paip1Q8VE62 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Paip1Q8VE62 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Paip1Q8VE62 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Paip1Q8VE62 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Paip1Q8VE62 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Paip1Q8VE62 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Paip1Q8VE62 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Paip1Q8VE62 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Paip1Q8VE62 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Paip1Q8VE62 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Paip1Q8VE62 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Paip1Q8VE62 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Paip1Q8VE62 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Paip1Q8VE62 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Paip1Q8VE62 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Paip1Q8VE62 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Paip1Q8VE62 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Paip1Q8VE62 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Paip1Q8VE62 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Paip1Q8VE62 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Paip1Q8VE62 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Paip1Q8VE62 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Paip1Q8VE62 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Paip1Q8VE62 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Paip1Q8VE62 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Paip1Q8VE62 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Paip1Q8VE62 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Paip1Q8VE62 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Paip1Q8VE62 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Paip1Q8VE62 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Paip1Q8VE62 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Paip1Q8VE62 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Paip1Q8VE62 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Paip1Q8VE62 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Paip1Q8VE62 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Paip1Q8VE62 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Paip1Q8VE62 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Paip1Q8VE62 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Paip1Q8VE62 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Paip1Q8VE62 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Paip1Q8VE62 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Paip1Q8VE62 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Paip1Q8VE62 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Paip1Q8VE62 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Paip1Q8VE62 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms