Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU5

Snrk, SNF-related serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrkQ8VDU5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SnrkQ8VDU5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SnrkQ8VDU5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SnrkQ8VDU5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SnrkQ8VDU5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SnrkQ8VDU5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SnrkQ8VDU5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SnrkQ8VDU5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SnrkQ8VDU5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SnrkQ8VDU5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SnrkQ8VDU5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SnrkQ8VDU5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SnrkQ8VDU5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SnrkQ8VDU5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SnrkQ8VDU5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SnrkQ8VDU5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SnrkQ8VDU5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SnrkQ8VDU5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SnrkQ8VDU5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SnrkQ8VDU5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SnrkQ8VDU5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SnrkQ8VDU5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SnrkQ8VDU5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SnrkQ8VDU5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SnrkQ8VDU5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SnrkQ8VDU5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SnrkQ8VDU5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SnrkQ8VDU5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SnrkQ8VDU5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SnrkQ8VDU5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SnrkQ8VDU5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SnrkQ8VDU5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SnrkQ8VDU5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SnrkQ8VDU5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SnrkQ8VDU5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SnrkQ8VDU5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SnrkQ8VDU5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SnrkQ8VDU5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SnrkQ8VDU5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SnrkQ8VDU5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SnrkQ8VDU5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SnrkQ8VDU5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SnrkQ8VDU5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SnrkQ8VDU5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SnrkQ8VDU5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SnrkQ8VDU5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SnrkQ8VDU5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SnrkQ8VDU5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SnrkQ8VDU5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SnrkQ8VDU5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SnrkQ8VDU5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SnrkQ8VDU5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SnrkQ8VDU5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SnrkQ8VDU5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SnrkQ8VDU5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SnrkQ8VDU5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SnrkQ8VDU5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SnrkQ8VDU5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SnrkQ8VDU5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SnrkQ8VDU5 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SnrkQ8VDU5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SnrkQ8VDU5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SnrkQ8VDU5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SnrkQ8VDU5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SnrkQ8VDU5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SnrkQ8VDU5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SnrkQ8VDU5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SnrkQ8VDU5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SnrkQ8VDU5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SnrkQ8VDU5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SnrkQ8VDU5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SnrkQ8VDU5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SnrkQ8VDU5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SnrkQ8VDU5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SnrkQ8VDU5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SnrkQ8VDU5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SnrkQ8VDU5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SnrkQ8VDU5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SnrkQ8VDU5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SnrkQ8VDU5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SnrkQ8VDU5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SnrkQ8VDU5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SnrkQ8VDU5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SnrkQ8VDU5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SnrkQ8VDU5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SnrkQ8VDU5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SnrkQ8VDU5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SnrkQ8VDU5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SnrkQ8VDU5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SnrkQ8VDU5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SnrkQ8VDU5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SnrkQ8VDU5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SnrkQ8VDU5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SnrkQ8VDU5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SnrkQ8VDU5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SnrkQ8VDU5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SnrkQ8VDU5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SnrkQ8VDU5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SnrkQ8VDU5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SnrkQ8VDU5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms