Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU3

Apol9a, Apol9a protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol9aQ8VDU3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Apol9aQ8VDU3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Apol9aQ8VDU3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Apol9aQ8VDU3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Apol9aQ8VDU3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Apol9aQ8VDU3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Apol9aQ8VDU3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Apol9aQ8VDU3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Apol9aQ8VDU3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Apol9aQ8VDU3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Apol9aQ8VDU3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Apol9aQ8VDU3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Apol9aQ8VDU3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Apol9aQ8VDU3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Apol9aQ8VDU3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Apol9aQ8VDU3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Apol9aQ8VDU3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Apol9aQ8VDU3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Apol9aQ8VDU3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Apol9aQ8VDU3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Apol9aQ8VDU3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Apol9aQ8VDU3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Apol9aQ8VDU3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Apol9aQ8VDU3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Apol9aQ8VDU3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Apol9aQ8VDU3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Apol9aQ8VDU3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Apol9aQ8VDU3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Apol9aQ8VDU3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Apol9aQ8VDU3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Apol9aQ8VDU3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Apol9aQ8VDU3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Apol9aQ8VDU3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Apol9aQ8VDU3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Apol9aQ8VDU3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Apol9aQ8VDU3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Apol9aQ8VDU3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Apol9aQ8VDU3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Apol9aQ8VDU3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Apol9aQ8VDU3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Apol9aQ8VDU3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Apol9aQ8VDU3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Apol9aQ8VDU3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Apol9aQ8VDU3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Apol9aQ8VDU3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Apol9aQ8VDU3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Apol9aQ8VDU3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Apol9aQ8VDU3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Apol9aQ8VDU3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Apol9aQ8VDU3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Apol9aQ8VDU3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Apol9aQ8VDU3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Apol9aQ8VDU3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Apol9aQ8VDU3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Apol9aQ8VDU3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Apol9aQ8VDU3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Apol9aQ8VDU3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Apol9aQ8VDU3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Apol9aQ8VDU3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Apol9aQ8VDU3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Apol9aQ8VDU3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Apol9aQ8VDU3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Apol9aQ8VDU3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Apol9aQ8VDU3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Apol9aQ8VDU3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Apol9aQ8VDU3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Apol9aQ8VDU3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Apol9aQ8VDU3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Apol9aQ8VDU3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Apol9aQ8VDU3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Apol9aQ8VDU3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Apol9aQ8VDU3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Apol9aQ8VDU3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Apol9aQ8VDU3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Apol9aQ8VDU3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Apol9aQ8VDU3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Apol9aQ8VDU3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Apol9aQ8VDU3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Apol9aQ8VDU3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Apol9aQ8VDU3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Apol9aQ8VDU3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Apol9aQ8VDU3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Apol9aQ8VDU3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Apol9aQ8VDU3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Apol9aQ8VDU3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Apol9aQ8VDU3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Apol9aQ8VDU3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Apol9aQ8VDU3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Apol9aQ8VDU3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Apol9aQ8VDU3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Apol9aQ8VDU3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Apol9aQ8VDU3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Apol9aQ8VDU3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Apol9aQ8VDU3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Apol9aQ8VDU3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Apol9aQ8VDU3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Apol9aQ8VDU3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Apol9aQ8VDU3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Apol9aQ8VDU3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Apol9aQ8VDU3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.7 ms