Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ubxn4Q8VCH8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ubxn4Q8VCH8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ubxn4Q8VCH8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ubxn4Q8VCH8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ubxn4Q8VCH8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ubxn4Q8VCH8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ubxn4Q8VCH8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ubxn4Q8VCH8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ubxn4Q8VCH8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ubxn4Q8VCH8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ubxn4Q8VCH8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ubxn4Q8VCH8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ubxn4Q8VCH8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ubxn4Q8VCH8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ubxn4Q8VCH8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ubxn4Q8VCH8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ubxn4Q8VCH8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ubxn4Q8VCH8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ubxn4Q8VCH8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubxn4Q8VCH8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubxn4Q8VCH8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubxn4Q8VCH8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ubxn4Q8VCH8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ubxn4Q8VCH8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ubxn4Q8VCH8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ubxn4Q8VCH8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ubxn4Q8VCH8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ubxn4Q8VCH8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ubxn4Q8VCH8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ubxn4Q8VCH8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ubxn4Q8VCH8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ubxn4Q8VCH8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ubxn4Q8VCH8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ubxn4Q8VCH8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ubxn4Q8VCH8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ubxn4Q8VCH8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ubxn4Q8VCH8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ubxn4Q8VCH8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ubxn4Q8VCH8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ubxn4Q8VCH8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ubxn4Q8VCH8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ubxn4Q8VCH8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ubxn4Q8VCH8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ubxn4Q8VCH8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ubxn4Q8VCH8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ubxn4Q8VCH8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ubxn4Q8VCH8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ubxn4Q8VCH8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ubxn4Q8VCH8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ubxn4Q8VCH8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ubxn4Q8VCH8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ubxn4Q8VCH8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ubxn4Q8VCH8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ubxn4Q8VCH8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ubxn4Q8VCH8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ubxn4Q8VCH8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubxn4Q8VCH8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubxn4Q8VCH8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubxn4Q8VCH8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubxn4Q8VCH8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubxn4Q8VCH8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ubxn4Q8VCH8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ubxn4Q8VCH8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ubxn4Q8VCH8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ubxn4Q8VCH8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ubxn4Q8VCH8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ubxn4Q8VCH8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ubxn4Q8VCH8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ubxn4Q8VCH8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ubxn4Q8VCH8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ubxn4Q8VCH8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ubxn4Q8VCH8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ubxn4Q8VCH8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ubxn4Q8VCH8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ubxn4Q8VCH8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ubxn4Q8VCH8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ubxn4Q8VCH8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ubxn4Q8VCH8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubxn4Q8VCH8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubxn4Q8VCH8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubxn4Q8VCH8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubxn4Q8VCH8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ubxn4Q8VCH8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ubxn4Q8VCH8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ubxn4Q8VCH8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ubxn4Q8VCH8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ubxn4Q8VCH8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ubxn4Q8VCH8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ubxn4Q8VCH8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ubxn4Q8VCH8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ubxn4Q8VCH8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ubxn4Q8VCH8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms