Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD5

Med17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med17Q8VCD5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Med17Q8VCD5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Med17Q8VCD5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Med17Q8VCD5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Med17Q8VCD5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Med17Q8VCD5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Med17Q8VCD5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Med17Q8VCD5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Med17Q8VCD5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Med17Q8VCD5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Med17Q8VCD5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Med17Q8VCD5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Med17Q8VCD5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Med17Q8VCD5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Med17Q8VCD5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Med17Q8VCD5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Med17Q8VCD5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Med17Q8VCD5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Med17Q8VCD5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Med17Q8VCD5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Med17Q8VCD5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Med17Q8VCD5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Med17Q8VCD5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Med17Q8VCD5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Med17Q8VCD5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Med17Q8VCD5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med17Q8VCD5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med17Q8VCD5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med17Q8VCD5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med17Q8VCD5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med17Q8VCD5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med17Q8VCD5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med17Q8VCD5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med17Q8VCD5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med17Q8VCD5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med17Q8VCD5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med17Q8VCD5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med17Q8VCD5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med17Q8VCD5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med17Q8VCD5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med17Q8VCD5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Med17Q8VCD5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Med17Q8VCD5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Med17Q8VCD5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Med17Q8VCD5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Med17Q8VCD5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Med17Q8VCD5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Med17Q8VCD5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Med17Q8VCD5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Med17Q8VCD5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Med17Q8VCD5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Med17Q8VCD5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Med17Q8VCD5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Med17Q8VCD5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Med17Q8VCD5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Med17Q8VCD5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Med17Q8VCD5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Med17Q8VCD5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Med17Q8VCD5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Med17Q8VCD5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Med17Q8VCD5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Med17Q8VCD5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Med17Q8VCD5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Med17Q8VCD5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Med17Q8VCD5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Med17Q8VCD5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Med17Q8VCD5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Med17Q8VCD5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Med17Q8VCD5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Med17Q8VCD5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Med17Q8VCD5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Med17Q8VCD5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Med17Q8VCD5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Med17Q8VCD5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Med17Q8VCD5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Med17Q8VCD5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Med17Q8VCD5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Med17Q8VCD5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Med17Q8VCD5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Med17Q8VCD5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Med17Q8VCD5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Med17Q8VCD5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Med17Q8VCD5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Med17Q8VCD5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Med17Q8VCD5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Med17Q8VCD5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Med17Q8VCD5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Med17Q8VCD5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Med17Q8VCD5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Med17Q8VCD5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Med17Q8VCD5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Med17Q8VCD5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Med17Q8VCD5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Med17Q8VCD5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Med17Q8VCD5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Med17Q8VCD5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Med17Q8VCD5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Med17Q8VCD5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Med17Q8VCD5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Med17Q8VCD5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms