Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4C2

Rufy2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy2Q8R4C2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rufy2Q8R4C2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rufy2Q8R4C2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rufy2Q8R4C2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rufy2Q8R4C2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rufy2Q8R4C2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Rufy2Q8R4C2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rufy2Q8R4C2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rufy2Q8R4C2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rufy2Q8R4C2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rufy2Q8R4C2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rufy2Q8R4C2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rufy2Q8R4C2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rufy2Q8R4C2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rufy2Q8R4C2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rufy2Q8R4C2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rufy2Q8R4C2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rufy2Q8R4C2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rufy2Q8R4C2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rufy2Q8R4C2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rufy2Q8R4C2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rufy2Q8R4C2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rufy2Q8R4C2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rufy2Q8R4C2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Rufy2Q8R4C2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rufy2Q8R4C2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rufy2Q8R4C2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rufy2Q8R4C2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rufy2Q8R4C2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rufy2Q8R4C2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rufy2Q8R4C2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rufy2Q8R4C2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rufy2Q8R4C2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rufy2Q8R4C2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rufy2Q8R4C2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rufy2Q8R4C2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rufy2Q8R4C2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rufy2Q8R4C2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rufy2Q8R4C2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rufy2Q8R4C2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rufy2Q8R4C2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rufy2Q8R4C2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rufy2Q8R4C2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rufy2Q8R4C2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rufy2Q8R4C2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rufy2Q8R4C2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Rufy2Q8R4C2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rufy2Q8R4C2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rufy2Q8R4C2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rufy2Q8R4C2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Rufy2Q8R4C2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rufy2Q8R4C2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rufy2Q8R4C2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rufy2Q8R4C2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rufy2Q8R4C2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rufy2Q8R4C2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rufy2Q8R4C2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rufy2Q8R4C2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rufy2Q8R4C2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rufy2Q8R4C2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rufy2Q8R4C2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rufy2Q8R4C2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rufy2Q8R4C2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rufy2Q8R4C2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rufy2Q8R4C2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rufy2Q8R4C2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rufy2Q8R4C2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rufy2Q8R4C2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Rufy2Q8R4C2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rufy2Q8R4C2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rufy2Q8R4C2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rufy2Q8R4C2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rufy2Q8R4C2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rufy2Q8R4C2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rufy2Q8R4C2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rufy2Q8R4C2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rufy2Q8R4C2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rufy2Q8R4C2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rufy2Q8R4C2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rufy2Q8R4C2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Rufy2Q8R4C2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rufy2Q8R4C2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rufy2Q8R4C2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rufy2Q8R4C2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rufy2Q8R4C2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rufy2Q8R4C2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rufy2Q8R4C2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rufy2Q8R4C2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rufy2Q8R4C2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rufy2Q8R4C2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Rufy2Q8R4C2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rufy2Q8R4C2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rufy2Q8R4C2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rufy2Q8R4C2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rufy2Q8R4C2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rufy2Q8R4C2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rufy2Q8R4C2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rufy2Q8R4C2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rufy2Q8R4C2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rufy2Q8R4C2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms