Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3J4

Mterf3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf3Q8R3J4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mterf3Q8R3J4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mterf3Q8R3J4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mterf3Q8R3J4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mterf3Q8R3J4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mterf3Q8R3J4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mterf3Q8R3J4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mterf3Q8R3J4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mterf3Q8R3J4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mterf3Q8R3J4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mterf3Q8R3J4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mterf3Q8R3J4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mterf3Q8R3J4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mterf3Q8R3J4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mterf3Q8R3J4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mterf3Q8R3J4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mterf3Q8R3J4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mterf3Q8R3J4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mterf3Q8R3J4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mterf3Q8R3J4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mterf3Q8R3J4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mterf3Q8R3J4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mterf3Q8R3J4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mterf3Q8R3J4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mterf3Q8R3J4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mterf3Q8R3J4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mterf3Q8R3J4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mterf3Q8R3J4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mterf3Q8R3J4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mterf3Q8R3J4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Mterf3Q8R3J4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mterf3Q8R3J4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mterf3Q8R3J4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mterf3Q8R3J4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mterf3Q8R3J4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mterf3Q8R3J4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mterf3Q8R3J4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mterf3Q8R3J4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mterf3Q8R3J4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mterf3Q8R3J4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mterf3Q8R3J4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mterf3Q8R3J4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mterf3Q8R3J4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mterf3Q8R3J4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mterf3Q8R3J4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mterf3Q8R3J4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mterf3Q8R3J4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mterf3Q8R3J4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mterf3Q8R3J4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mterf3Q8R3J4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mterf3Q8R3J4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mterf3Q8R3J4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mterf3Q8R3J4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mterf3Q8R3J4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mterf3Q8R3J4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mterf3Q8R3J4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mterf3Q8R3J4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mterf3Q8R3J4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mterf3Q8R3J4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mterf3Q8R3J4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mterf3Q8R3J4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mterf3Q8R3J4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mterf3Q8R3J4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mterf3Q8R3J4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mterf3Q8R3J4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mterf3Q8R3J4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mterf3Q8R3J4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mterf3Q8R3J4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mterf3Q8R3J4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mterf3Q8R3J4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mterf3Q8R3J4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mterf3Q8R3J4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mterf3Q8R3J4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mterf3Q8R3J4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mterf3Q8R3J4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mterf3Q8R3J4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mterf3Q8R3J4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mterf3Q8R3J4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mterf3Q8R3J4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mterf3Q8R3J4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mterf3Q8R3J4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mterf3Q8R3J4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mterf3Q8R3J4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mterf3Q8R3J4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mterf3Q8R3J4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mterf3Q8R3J4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mterf3Q8R3J4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mterf3Q8R3J4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mterf3Q8R3J4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mterf3Q8R3J4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mterf3Q8R3J4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mterf3Q8R3J4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mterf3Q8R3J4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mterf3Q8R3J4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mterf3Q8R3J4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mterf3Q8R3J4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mterf3Q8R3J4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mterf3Q8R3J4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mterf3Q8R3J4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Mterf3Q8R3J4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms