Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc12Q8R344 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc12Q8R344 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc12Q8R344 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc12Q8R344 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc12Q8R344 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc12Q8R344 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc12Q8R344 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc12Q8R344 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc12Q8R344 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc12Q8R344 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc12Q8R344 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc12Q8R344 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc12Q8R344 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc12Q8R344 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc12Q8R344 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc12Q8R344 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc12Q8R344 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc12Q8R344 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc12Q8R344 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc12Q8R344 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc12Q8R344 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc12Q8R344 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc12Q8R344 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc12Q8R344 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc12Q8R344 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc12Q8R344 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc12Q8R344 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc12Q8R344 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc12Q8R344 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc12Q8R344 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc12Q8R344 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc12Q8R344 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc12Q8R344 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc12Q8R344 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc12Q8R344 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc12Q8R344 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc12Q8R344 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc12Q8R344 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc12Q8R344 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc12Q8R344 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc12Q8R344 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc12Q8R344 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc12Q8R344 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc12Q8R344 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc12Q8R344 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc12Q8R344 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc12Q8R344 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc12Q8R344 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc12Q8R344 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc12Q8R344 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc12Q8R344 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc12Q8R344 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc12Q8R344 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc12Q8R344 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc12Q8R344 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc12Q8R344 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc12Q8R344 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc12Q8R344 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc12Q8R344 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc12Q8R344 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc12Q8R344 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc12Q8R344 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc12Q8R344 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc12Q8R344 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc12Q8R344 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc12Q8R344 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc12Q8R344 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc12Q8R344 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc12Q8R344 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc12Q8R344 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc12Q8R344 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc12Q8R344 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc12Q8R344 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc12Q8R344 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc12Q8R344 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc12Q8R344 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc12Q8R344 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc12Q8R344 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc12Q8R344 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc12Q8R344 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc12Q8R344 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc12Q8R344 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc12Q8R344 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc12Q8R344 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc12Q8R344 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc12Q8R344 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc12Q8R344 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc12Q8R344 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc12Q8R344 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc12Q8R344 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc12Q8R344 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc12Q8R344 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc12Q8R344 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc12Q8R344 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc12Q8R344 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc12Q8R344 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc12Q8R344 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc12Q8R344 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc12Q8R344 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms