Protein–RNA interactions for Protein: Q8R332

Nup58, Nucleoporin p58/p45, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup58Q8R332 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nup58Q8R332 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nup58Q8R332 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nup58Q8R332 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Nup58Q8R332 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nup58Q8R332 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Nup58Q8R332 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nup58Q8R332 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nup58Q8R332 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nup58Q8R332 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nup58Q8R332 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nup58Q8R332 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nup58Q8R332 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nup58Q8R332 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nup58Q8R332 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nup58Q8R332 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nup58Q8R332 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nup58Q8R332 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nup58Q8R332 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nup58Q8R332 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nup58Q8R332 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nup58Q8R332 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nup58Q8R332 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nup58Q8R332 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nup58Q8R332 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nup58Q8R332 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nup58Q8R332 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nup58Q8R332 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nup58Q8R332 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nup58Q8R332 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nup58Q8R332 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nup58Q8R332 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nup58Q8R332 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nup58Q8R332 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nup58Q8R332 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nup58Q8R332 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nup58Q8R332 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nup58Q8R332 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nup58Q8R332 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nup58Q8R332 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Nup58Q8R332 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nup58Q8R332 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nup58Q8R332 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nup58Q8R332 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nup58Q8R332 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nup58Q8R332 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nup58Q8R332 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nup58Q8R332 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nup58Q8R332 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nup58Q8R332 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nup58Q8R332 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nup58Q8R332 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nup58Q8R332 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nup58Q8R332 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nup58Q8R332 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nup58Q8R332 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nup58Q8R332 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nup58Q8R332 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nup58Q8R332 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nup58Q8R332 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nup58Q8R332 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nup58Q8R332 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nup58Q8R332 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nup58Q8R332 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nup58Q8R332 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nup58Q8R332 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nup58Q8R332 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nup58Q8R332 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nup58Q8R332 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nup58Q8R332 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Nup58Q8R332 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nup58Q8R332 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nup58Q8R332 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nup58Q8R332 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nup58Q8R332 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nup58Q8R332 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nup58Q8R332 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nup58Q8R332 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nup58Q8R332 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nup58Q8R332 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nup58Q8R332 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nup58Q8R332 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nup58Q8R332 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nup58Q8R332 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nup58Q8R332 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nup58Q8R332 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nup58Q8R332 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nup58Q8R332 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nup58Q8R332 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nup58Q8R332 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nup58Q8R332 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nup58Q8R332 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nup58Q8R332 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nup58Q8R332 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nup58Q8R332 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nup58Q8R332 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nup58Q8R332 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Nup58Q8R332 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nup58Q8R332 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nup58Q8R332 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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