Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn1r200Q8R281 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn1r200Q8R281 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn1r200Q8R281 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn1r200Q8R281 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn1r200Q8R281 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn1r200Q8R281 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn1r200Q8R281 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn1r200Q8R281 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn1r200Q8R281 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r200Q8R281 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r200Q8R281 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r200Q8R281 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r200Q8R281 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r200Q8R281 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r200Q8R281 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r200Q8R281 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r200Q8R281 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn1r200Q8R281 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
Vmn1r200Q8R281 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn1r200Q8R281 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn1r200Q8R281 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn1r200Q8R281 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn1r200Q8R281 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn1r200Q8R281 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vmn1r200Q8R281 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r200Q8R281 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r200Q8R281 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r200Q8R281 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r200Q8R281 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r200Q8R281 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r200Q8R281 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r200Q8R281 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r200Q8R281 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r200Q8R281 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r200Q8R281 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r200Q8R281 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r200Q8R281 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Vmn1r200Q8R281 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn1r200Q8R281 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn1r200Q8R281 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn1r200Q8R281 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn1r200Q8R281 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn1r200Q8R281 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn1r200Q8R281 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn1r200Q8R281 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn1r200Q8R281 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Vmn1r200Q8R281 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn1r200Q8R281 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn1r200Q8R281 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn1r200Q8R281 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn1r200Q8R281 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn1r200Q8R281 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn1r200Q8R281 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn1r200Q8R281 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn1r200Q8R281 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn1r200Q8R281 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn1r200Q8R281 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn1r200Q8R281 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn1r200Q8R281 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn1r200Q8R281 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Vmn1r200Q8R281 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn1r200Q8R281 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn1r200Q8R281 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn1r200Q8R281 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn1r200Q8R281 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Vmn1r200Q8R281 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vmn1r200Q8R281 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vmn1r200Q8R281 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vmn1r200Q8R281 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vmn1r200Q8R281 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vmn1r200Q8R281 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vmn1r200Q8R281 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Vmn1r200Q8R281 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Vmn1r200Q8R281 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vmn1r200Q8R281 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vmn1r200Q8R281 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vmn1r200Q8R281 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vmn1r200Q8R281 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vmn1r200Q8R281 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vmn1r200Q8R281 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vmn1r200Q8R281 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vmn1r200Q8R281 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vmn1r200Q8R281 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Vmn1r200Q8R281 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmn1r200Q8R281 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmn1r200Q8R281 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmn1r200Q8R281 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmn1r200Q8R281 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmn1r200Q8R281 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmn1r200Q8R281 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmn1r200Q8R281 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmn1r200Q8R281 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Vmn1r200Q8R281 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmn1r200Q8R281 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmn1r200Q8R281 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmn1r200Q8R281 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmn1r200Q8R281 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmn1r200Q8R281 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Vmn1r200Q8R281 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms