Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sf3b4Q8QZY9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sf3b4Q8QZY9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sf3b4Q8QZY9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sf3b4Q8QZY9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sf3b4Q8QZY9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sf3b4Q8QZY9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sf3b4Q8QZY9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sf3b4Q8QZY9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sf3b4Q8QZY9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sf3b4Q8QZY9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sf3b4Q8QZY9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sf3b4Q8QZY9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sf3b4Q8QZY9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sf3b4Q8QZY9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sf3b4Q8QZY9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sf3b4Q8QZY9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sf3b4Q8QZY9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sf3b4Q8QZY9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sf3b4Q8QZY9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sf3b4Q8QZY9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sf3b4Q8QZY9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sf3b4Q8QZY9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sf3b4Q8QZY9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sf3b4Q8QZY9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sf3b4Q8QZY9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sf3b4Q8QZY9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sf3b4Q8QZY9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sf3b4Q8QZY9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sf3b4Q8QZY9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Sf3b4Q8QZY9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sf3b4Q8QZY9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sf3b4Q8QZY9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sf3b4Q8QZY9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sf3b4Q8QZY9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sf3b4Q8QZY9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sf3b4Q8QZY9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sf3b4Q8QZY9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sf3b4Q8QZY9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sf3b4Q8QZY9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Sf3b4Q8QZY9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Sf3b4Q8QZY9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sf3b4Q8QZY9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sf3b4Q8QZY9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sf3b4Q8QZY9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sf3b4Q8QZY9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sf3b4Q8QZY9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sf3b4Q8QZY9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sf3b4Q8QZY9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sf3b4Q8QZY9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sf3b4Q8QZY9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sf3b4Q8QZY9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sf3b4Q8QZY9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sf3b4Q8QZY9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sf3b4Q8QZY9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sf3b4Q8QZY9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sf3b4Q8QZY9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sf3b4Q8QZY9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sf3b4Q8QZY9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sf3b4Q8QZY9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sf3b4Q8QZY9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sf3b4Q8QZY9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sf3b4Q8QZY9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sf3b4Q8QZY9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sf3b4Q8QZY9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sf3b4Q8QZY9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sf3b4Q8QZY9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sf3b4Q8QZY9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sf3b4Q8QZY9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sf3b4Q8QZY9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sf3b4Q8QZY9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sf3b4Q8QZY9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sf3b4Q8QZY9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Sf3b4Q8QZY9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sf3b4Q8QZY9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sf3b4Q8QZY9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sf3b4Q8QZY9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sf3b4Q8QZY9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sf3b4Q8QZY9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sf3b4Q8QZY9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sf3b4Q8QZY9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sf3b4Q8QZY9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sf3b4Q8QZY9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sf3b4Q8QZY9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sf3b4Q8QZY9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sf3b4Q8QZY9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sf3b4Q8QZY9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sf3b4Q8QZY9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sf3b4Q8QZY9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sf3b4Q8QZY9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sf3b4Q8QZY9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sf3b4Q8QZY9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sf3b4Q8QZY9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sf3b4Q8QZY9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sf3b4Q8QZY9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sf3b4Q8QZY9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Sf3b4Q8QZY9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sf3b4Q8QZY9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sf3b4Q8QZY9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sf3b4Q8QZY9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms