Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc12Q8K5B8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc12Q8K5B8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxc12Q8K5B8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc12Q8K5B8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc12Q8K5B8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc12Q8K5B8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc12Q8K5B8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc12Q8K5B8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc12Q8K5B8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc12Q8K5B8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc12Q8K5B8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc12Q8K5B8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc12Q8K5B8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc12Q8K5B8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc12Q8K5B8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc12Q8K5B8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc12Q8K5B8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc12Q8K5B8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc12Q8K5B8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxc12Q8K5B8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc12Q8K5B8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc12Q8K5B8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc12Q8K5B8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc12Q8K5B8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc12Q8K5B8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc12Q8K5B8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc12Q8K5B8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc12Q8K5B8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc12Q8K5B8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc12Q8K5B8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc12Q8K5B8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxc12Q8K5B8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Hoxc12Q8K5B8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hoxc12Q8K5B8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms