Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4G1

Ltbp4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltbp4Q8K4G1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ltbp4Q8K4G1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ltbp4Q8K4G1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ltbp4Q8K4G1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ltbp4Q8K4G1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ltbp4Q8K4G1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ltbp4Q8K4G1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ltbp4Q8K4G1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ltbp4Q8K4G1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Ltbp4Q8K4G1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ltbp4Q8K4G1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ltbp4Q8K4G1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ltbp4Q8K4G1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ltbp4Q8K4G1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ltbp4Q8K4G1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ltbp4Q8K4G1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ltbp4Q8K4G1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ltbp4Q8K4G1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ltbp4Q8K4G1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ltbp4Q8K4G1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ltbp4Q8K4G1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ltbp4Q8K4G1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ltbp4Q8K4G1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ltbp4Q8K4G1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ltbp4Q8K4G1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ltbp4Q8K4G1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ltbp4Q8K4G1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ltbp4Q8K4G1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ltbp4Q8K4G1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ltbp4Q8K4G1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ltbp4Q8K4G1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Ltbp4Q8K4G1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ltbp4Q8K4G1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ltbp4Q8K4G1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ltbp4Q8K4G1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ltbp4Q8K4G1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ltbp4Q8K4G1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ltbp4Q8K4G1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ltbp4Q8K4G1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ltbp4Q8K4G1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ltbp4Q8K4G1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ltbp4Q8K4G1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ltbp4Q8K4G1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ltbp4Q8K4G1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ltbp4Q8K4G1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ltbp4Q8K4G1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ltbp4Q8K4G1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ltbp4Q8K4G1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ltbp4Q8K4G1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ltbp4Q8K4G1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ltbp4Q8K4G1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ltbp4Q8K4G1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ltbp4Q8K4G1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ltbp4Q8K4G1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ltbp4Q8K4G1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ltbp4Q8K4G1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ltbp4Q8K4G1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ltbp4Q8K4G1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ltbp4Q8K4G1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ltbp4Q8K4G1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ltbp4Q8K4G1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Ltbp4Q8K4G1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ltbp4Q8K4G1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ltbp4Q8K4G1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ltbp4Q8K4G1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ltbp4Q8K4G1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ltbp4Q8K4G1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ltbp4Q8K4G1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ltbp4Q8K4G1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Ltbp4Q8K4G1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ltbp4Q8K4G1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ltbp4Q8K4G1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ltbp4Q8K4G1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ltbp4Q8K4G1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ltbp4Q8K4G1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ltbp4Q8K4G1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ltbp4Q8K4G1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ltbp4Q8K4G1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ltbp4Q8K4G1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ltbp4Q8K4G1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ltbp4Q8K4G1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ltbp4Q8K4G1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ltbp4Q8K4G1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ltbp4Q8K4G1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ltbp4Q8K4G1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ltbp4Q8K4G1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Ltbp4Q8K4G1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ltbp4Q8K4G1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ltbp4Q8K4G1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ltbp4Q8K4G1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ltbp4Q8K4G1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ltbp4Q8K4G1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ltbp4Q8K4G1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ltbp4Q8K4G1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ltbp4Q8K4G1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ltbp4Q8K4G1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ltbp4Q8K4G1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ltbp4Q8K4G1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ltbp4Q8K4G1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ltbp4Q8K4G1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms