Protein–RNA interactions for Protein: Q8K375

Lrrc56, Leucine-rich repeat-containing protein 56, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc56Q8K375 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc56Q8K375 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc56Q8K375 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc56Q8K375 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc56Q8K375 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc56Q8K375 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc56Q8K375 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc56Q8K375 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc56Q8K375 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc56Q8K375 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc56Q8K375 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc56Q8K375 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc56Q8K375 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc56Q8K375 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc56Q8K375 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc56Q8K375 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc56Q8K375 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc56Q8K375 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc56Q8K375 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc56Q8K375 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc56Q8K375 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc56Q8K375 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc56Q8K375 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc56Q8K375 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc56Q8K375 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc56Q8K375 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc56Q8K375 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc56Q8K375 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc56Q8K375 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc56Q8K375 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc56Q8K375 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc56Q8K375 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Lrrc56Q8K375 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc56Q8K375 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc56Q8K375 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc56Q8K375 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc56Q8K375 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc56Q8K375 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc56Q8K375 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc56Q8K375 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc56Q8K375 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc56Q8K375 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc56Q8K375 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc56Q8K375 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc56Q8K375 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc56Q8K375 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc56Q8K375 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc56Q8K375 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc56Q8K375 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc56Q8K375 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc56Q8K375 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc56Q8K375 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc56Q8K375 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc56Q8K375 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc56Q8K375 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc56Q8K375 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc56Q8K375 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc56Q8K375 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc56Q8K375 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc56Q8K375 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc56Q8K375 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc56Q8K375 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc56Q8K375 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc56Q8K375 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc56Q8K375 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc56Q8K375 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc56Q8K375 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc56Q8K375 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc56Q8K375 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc56Q8K375 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc56Q8K375 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc56Q8K375 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc56Q8K375 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc56Q8K375 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc56Q8K375 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc56Q8K375 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc56Q8K375 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc56Q8K375 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc56Q8K375 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc56Q8K375 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc56Q8K375 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc56Q8K375 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc56Q8K375 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc56Q8K375 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc56Q8K375 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc56Q8K375 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc56Q8K375 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc56Q8K375 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc56Q8K375 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrrc56Q8K375 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrrc56Q8K375 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrrc56Q8K375 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc56Q8K375 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc56Q8K375 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc56Q8K375 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc56Q8K375 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc56Q8K375 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc56Q8K375 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc56Q8K375 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc56Q8K375 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms