Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ssh3Q8K330 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ssh3Q8K330 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ssh3Q8K330 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ssh3Q8K330 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ssh3Q8K330 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ssh3Q8K330 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ssh3Q8K330 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Ssh3Q8K330 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ssh3Q8K330 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ssh3Q8K330 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ssh3Q8K330 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ssh3Q8K330 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ssh3Q8K330 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ssh3Q8K330 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ssh3Q8K330 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ssh3Q8K330 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ssh3Q8K330 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ssh3Q8K330 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ssh3Q8K330 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ssh3Q8K330 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ssh3Q8K330 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ssh3Q8K330 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ssh3Q8K330 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ssh3Q8K330 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ssh3Q8K330 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ssh3Q8K330 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ssh3Q8K330 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ssh3Q8K330 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ssh3Q8K330 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ssh3Q8K330 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ssh3Q8K330 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ssh3Q8K330 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ssh3Q8K330 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ssh3Q8K330 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ssh3Q8K330 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ssh3Q8K330 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ssh3Q8K330 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ssh3Q8K330 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ssh3Q8K330 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ssh3Q8K330 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ssh3Q8K330 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ssh3Q8K330 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ssh3Q8K330 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ssh3Q8K330 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ssh3Q8K330 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ssh3Q8K330 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ssh3Q8K330 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ssh3Q8K330 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ssh3Q8K330 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ssh3Q8K330 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ssh3Q8K330 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ssh3Q8K330 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ssh3Q8K330 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ssh3Q8K330 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ssh3Q8K330 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ssh3Q8K330 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ssh3Q8K330 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ssh3Q8K330 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ssh3Q8K330 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ssh3Q8K330 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ssh3Q8K330 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ssh3Q8K330 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ssh3Q8K330 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ssh3Q8K330 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ssh3Q8K330 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ssh3Q8K330 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ssh3Q8K330 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ssh3Q8K330 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ssh3Q8K330 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ssh3Q8K330 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ssh3Q8K330 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ssh3Q8K330 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ssh3Q8K330 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ssh3Q8K330 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ssh3Q8K330 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ssh3Q8K330 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ssh3Q8K330 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ssh3Q8K330 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ssh3Q8K330 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ssh3Q8K330 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ssh3Q8K330 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ssh3Q8K330 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ssh3Q8K330 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ssh3Q8K330 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ssh3Q8K330 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ssh3Q8K330 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ssh3Q8K330 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ssh3Q8K330 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ssh3Q8K330 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ssh3Q8K330 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ssh3Q8K330 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ssh3Q8K330 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ssh3Q8K330 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ssh3Q8K330 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ssh3Q8K330 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ssh3Q8K330 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ssh3Q8K330 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ssh3Q8K330 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ssh3Q8K330 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms