Protein–RNA interactions for Protein: Q8K305

Nsl1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsl1Q8K305 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nsl1Q8K305 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nsl1Q8K305 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nsl1Q8K305 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nsl1Q8K305 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nsl1Q8K305 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nsl1Q8K305 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nsl1Q8K305 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nsl1Q8K305 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nsl1Q8K305 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nsl1Q8K305 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Nsl1Q8K305 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nsl1Q8K305 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nsl1Q8K305 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nsl1Q8K305 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nsl1Q8K305 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nsl1Q8K305 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nsl1Q8K305 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nsl1Q8K305 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nsl1Q8K305 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nsl1Q8K305 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nsl1Q8K305 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nsl1Q8K305 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Nsl1Q8K305 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nsl1Q8K305 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nsl1Q8K305 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nsl1Q8K305 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nsl1Q8K305 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nsl1Q8K305 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nsl1Q8K305 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nsl1Q8K305 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nsl1Q8K305 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nsl1Q8K305 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nsl1Q8K305 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Nsl1Q8K305 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nsl1Q8K305 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nsl1Q8K305 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nsl1Q8K305 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nsl1Q8K305 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nsl1Q8K305 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nsl1Q8K305 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nsl1Q8K305 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nsl1Q8K305 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nsl1Q8K305 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nsl1Q8K305 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nsl1Q8K305 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nsl1Q8K305 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nsl1Q8K305 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nsl1Q8K305 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nsl1Q8K305 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nsl1Q8K305 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nsl1Q8K305 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nsl1Q8K305 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nsl1Q8K305 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nsl1Q8K305 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nsl1Q8K305 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nsl1Q8K305 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nsl1Q8K305 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nsl1Q8K305 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nsl1Q8K305 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nsl1Q8K305 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nsl1Q8K305 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nsl1Q8K305 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nsl1Q8K305 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nsl1Q8K305 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nsl1Q8K305 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nsl1Q8K305 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nsl1Q8K305 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nsl1Q8K305 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nsl1Q8K305 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nsl1Q8K305 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nsl1Q8K305 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nsl1Q8K305 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nsl1Q8K305 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nsl1Q8K305 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nsl1Q8K305 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nsl1Q8K305 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nsl1Q8K305 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nsl1Q8K305 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nsl1Q8K305 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nsl1Q8K305 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nsl1Q8K305 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nsl1Q8K305 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nsl1Q8K305 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nsl1Q8K305 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nsl1Q8K305 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nsl1Q8K305 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nsl1Q8K305 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nsl1Q8K305 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nsl1Q8K305 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nsl1Q8K305 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nsl1Q8K305 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nsl1Q8K305 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nsl1Q8K305 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nsl1Q8K305 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nsl1Q8K305 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nsl1Q8K305 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nsl1Q8K305 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nsl1Q8K305 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nsl1Q8K305 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112 ms