Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2T1

Nmral1, NmrA-like family domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmral1Q8K2T1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nmral1Q8K2T1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nmral1Q8K2T1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nmral1Q8K2T1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nmral1Q8K2T1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nmral1Q8K2T1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nmral1Q8K2T1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nmral1Q8K2T1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nmral1Q8K2T1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Nmral1Q8K2T1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Nmral1Q8K2T1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Nmral1Q8K2T1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nmral1Q8K2T1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nmral1Q8K2T1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nmral1Q8K2T1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nmral1Q8K2T1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nmral1Q8K2T1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nmral1Q8K2T1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nmral1Q8K2T1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nmral1Q8K2T1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nmral1Q8K2T1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nmral1Q8K2T1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nmral1Q8K2T1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nmral1Q8K2T1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nmral1Q8K2T1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nmral1Q8K2T1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nmral1Q8K2T1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nmral1Q8K2T1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nmral1Q8K2T1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nmral1Q8K2T1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nmral1Q8K2T1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nmral1Q8K2T1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nmral1Q8K2T1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nmral1Q8K2T1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nmral1Q8K2T1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nmral1Q8K2T1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nmral1Q8K2T1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nmral1Q8K2T1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nmral1Q8K2T1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nmral1Q8K2T1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nmral1Q8K2T1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nmral1Q8K2T1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nmral1Q8K2T1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nmral1Q8K2T1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nmral1Q8K2T1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nmral1Q8K2T1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nmral1Q8K2T1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nmral1Q8K2T1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nmral1Q8K2T1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nmral1Q8K2T1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nmral1Q8K2T1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nmral1Q8K2T1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nmral1Q8K2T1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nmral1Q8K2T1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nmral1Q8K2T1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nmral1Q8K2T1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Nmral1Q8K2T1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nmral1Q8K2T1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nmral1Q8K2T1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nmral1Q8K2T1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nmral1Q8K2T1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nmral1Q8K2T1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nmral1Q8K2T1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nmral1Q8K2T1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nmral1Q8K2T1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nmral1Q8K2T1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Nmral1Q8K2T1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nmral1Q8K2T1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nmral1Q8K2T1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nmral1Q8K2T1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nmral1Q8K2T1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nmral1Q8K2T1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nmral1Q8K2T1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nmral1Q8K2T1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Nmral1Q8K2T1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nmral1Q8K2T1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nmral1Q8K2T1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nmral1Q8K2T1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nmral1Q8K2T1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nmral1Q8K2T1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nmral1Q8K2T1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nmral1Q8K2T1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nmral1Q8K2T1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nmral1Q8K2T1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nmral1Q8K2T1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nmral1Q8K2T1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nmral1Q8K2T1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nmral1Q8K2T1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nmral1Q8K2T1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nmral1Q8K2T1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nmral1Q8K2T1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nmral1Q8K2T1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nmral1Q8K2T1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nmral1Q8K2T1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nmral1Q8K2T1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nmral1Q8K2T1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nmral1Q8K2T1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nmral1Q8K2T1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nmral1Q8K2T1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nmral1Q8K2T1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms