Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trappc12Q8K2L8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trappc12Q8K2L8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trappc12Q8K2L8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trappc12Q8K2L8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Trappc12Q8K2L8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Trappc12Q8K2L8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trappc12Q8K2L8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trappc12Q8K2L8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trappc12Q8K2L8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trappc12Q8K2L8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trappc12Q8K2L8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trappc12Q8K2L8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Trappc12Q8K2L8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trappc12Q8K2L8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trappc12Q8K2L8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trappc12Q8K2L8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trappc12Q8K2L8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trappc12Q8K2L8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trappc12Q8K2L8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trappc12Q8K2L8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trappc12Q8K2L8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trappc12Q8K2L8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trappc12Q8K2L8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trappc12Q8K2L8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trappc12Q8K2L8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trappc12Q8K2L8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trappc12Q8K2L8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trappc12Q8K2L8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trappc12Q8K2L8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trappc12Q8K2L8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trappc12Q8K2L8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trappc12Q8K2L8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trappc12Q8K2L8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trappc12Q8K2L8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trappc12Q8K2L8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trappc12Q8K2L8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trappc12Q8K2L8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trappc12Q8K2L8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trappc12Q8K2L8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trappc12Q8K2L8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Trappc12Q8K2L8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trappc12Q8K2L8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trappc12Q8K2L8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trappc12Q8K2L8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Trappc12Q8K2L8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trappc12Q8K2L8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trappc12Q8K2L8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trappc12Q8K2L8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Trappc12Q8K2L8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trappc12Q8K2L8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trappc12Q8K2L8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trappc12Q8K2L8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trappc12Q8K2L8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trappc12Q8K2L8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trappc12Q8K2L8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trappc12Q8K2L8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trappc12Q8K2L8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Trappc12Q8K2L8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trappc12Q8K2L8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trappc12Q8K2L8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trappc12Q8K2L8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Trappc12Q8K2L8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trappc12Q8K2L8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trappc12Q8K2L8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trappc12Q8K2L8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trappc12Q8K2L8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Trappc12Q8K2L8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trappc12Q8K2L8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trappc12Q8K2L8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trappc12Q8K2L8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trappc12Q8K2L8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trappc12Q8K2L8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trappc12Q8K2L8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trappc12Q8K2L8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trappc12Q8K2L8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trappc12Q8K2L8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trappc12Q8K2L8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trappc12Q8K2L8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trappc12Q8K2L8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trappc12Q8K2L8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trappc12Q8K2L8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trappc12Q8K2L8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trappc12Q8K2L8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trappc12Q8K2L8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trappc12Q8K2L8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trappc12Q8K2L8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trappc12Q8K2L8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trappc12Q8K2L8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trappc12Q8K2L8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trappc12Q8K2L8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trappc12Q8K2L8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trappc12Q8K2L8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trappc12Q8K2L8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trappc12Q8K2L8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trappc12Q8K2L8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trappc12Q8K2L8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trappc12Q8K2L8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trappc12Q8K2L8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trappc12Q8K2L8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms