Protein–RNA interactions for Protein: Q8K296

Mtmr3, Myotubularin-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr3Q8K296 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mtmr3Q8K296 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mtmr3Q8K296 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mtmr3Q8K296 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mtmr3Q8K296 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mtmr3Q8K296 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Mtmr3Q8K296 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mtmr3Q8K296 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mtmr3Q8K296 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Mtmr3Q8K296 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mtmr3Q8K296 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mtmr3Q8K296 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mtmr3Q8K296 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mtmr3Q8K296 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mtmr3Q8K296 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mtmr3Q8K296 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mtmr3Q8K296 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mtmr3Q8K296 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mtmr3Q8K296 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mtmr3Q8K296 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mtmr3Q8K296 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mtmr3Q8K296 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mtmr3Q8K296 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mtmr3Q8K296 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mtmr3Q8K296 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mtmr3Q8K296 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mtmr3Q8K296 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mtmr3Q8K296 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mtmr3Q8K296 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mtmr3Q8K296 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mtmr3Q8K296 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mtmr3Q8K296 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mtmr3Q8K296 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mtmr3Q8K296 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mtmr3Q8K296 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mtmr3Q8K296 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mtmr3Q8K296 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mtmr3Q8K296 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mtmr3Q8K296 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mtmr3Q8K296 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mtmr3Q8K296 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mtmr3Q8K296 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mtmr3Q8K296 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mtmr3Q8K296 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mtmr3Q8K296 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Mtmr3Q8K296 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mtmr3Q8K296 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mtmr3Q8K296 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mtmr3Q8K296 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mtmr3Q8K296 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mtmr3Q8K296 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mtmr3Q8K296 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mtmr3Q8K296 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mtmr3Q8K296 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mtmr3Q8K296 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mtmr3Q8K296 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mtmr3Q8K296 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mtmr3Q8K296 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mtmr3Q8K296 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Mtmr3Q8K296 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mtmr3Q8K296 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mtmr3Q8K296 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mtmr3Q8K296 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mtmr3Q8K296 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mtmr3Q8K296 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Mtmr3Q8K296 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Mtmr3Q8K296 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Mtmr3Q8K296 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mtmr3Q8K296 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mtmr3Q8K296 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mtmr3Q8K296 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mtmr3Q8K296 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mtmr3Q8K296 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mtmr3Q8K296 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mtmr3Q8K296 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Mtmr3Q8K296 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Mtmr3Q8K296 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mtmr3Q8K296 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mtmr3Q8K296 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mtmr3Q8K296 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mtmr3Q8K296 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mtmr3Q8K296 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mtmr3Q8K296 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mtmr3Q8K296 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mtmr3Q8K296 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mtmr3Q8K296 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mtmr3Q8K296 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mtmr3Q8K296 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mtmr3Q8K296 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mtmr3Q8K296 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mtmr3Q8K296 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mtmr3Q8K296 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mtmr3Q8K296 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mtmr3Q8K296 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mtmr3Q8K296 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mtmr3Q8K296 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mtmr3Q8K296 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Mtmr3Q8K296 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mtmr3Q8K296 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mtmr3Q8K296 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms