Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fcho1Q8K285 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fcho1Q8K285 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fcho1Q8K285 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fcho1Q8K285 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fcho1Q8K285 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fcho1Q8K285 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fcho1Q8K285 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fcho1Q8K285 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fcho1Q8K285 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fcho1Q8K285 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fcho1Q8K285 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fcho1Q8K285 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fcho1Q8K285 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fcho1Q8K285 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fcho1Q8K285 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fcho1Q8K285 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fcho1Q8K285 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fcho1Q8K285 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fcho1Q8K285 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fcho1Q8K285 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fcho1Q8K285 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fcho1Q8K285 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fcho1Q8K285 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fcho1Q8K285 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Fcho1Q8K285 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fcho1Q8K285 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fcho1Q8K285 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fcho1Q8K285 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fcho1Q8K285 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fcho1Q8K285 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fcho1Q8K285 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fcho1Q8K285 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Fcho1Q8K285 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fcho1Q8K285 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fcho1Q8K285 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fcho1Q8K285 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fcho1Q8K285 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fcho1Q8K285 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fcho1Q8K285 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fcho1Q8K285 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fcho1Q8K285 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fcho1Q8K285 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Fcho1Q8K285 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fcho1Q8K285 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fcho1Q8K285 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fcho1Q8K285 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fcho1Q8K285 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fcho1Q8K285 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fcho1Q8K285 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fcho1Q8K285 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fcho1Q8K285 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fcho1Q8K285 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fcho1Q8K285 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fcho1Q8K285 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fcho1Q8K285 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fcho1Q8K285 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fcho1Q8K285 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fcho1Q8K285 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fcho1Q8K285 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fcho1Q8K285 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fcho1Q8K285 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fcho1Q8K285 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fcho1Q8K285 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fcho1Q8K285 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fcho1Q8K285 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fcho1Q8K285 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fcho1Q8K285 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fcho1Q8K285 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fcho1Q8K285 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fcho1Q8K285 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fcho1Q8K285 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fcho1Q8K285 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fcho1Q8K285 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fcho1Q8K285 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fcho1Q8K285 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fcho1Q8K285 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fcho1Q8K285 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fcho1Q8K285 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fcho1Q8K285 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fcho1Q8K285 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fcho1Q8K285 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fcho1Q8K285 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fcho1Q8K285 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fcho1Q8K285 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fcho1Q8K285 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fcho1Q8K285 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fcho1Q8K285 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fcho1Q8K285 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fcho1Q8K285 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Fcho1Q8K285 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fcho1Q8K285 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fcho1Q8K285 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fcho1Q8K285 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fcho1Q8K285 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fcho1Q8K285 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fcho1Q8K285 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fcho1Q8K285 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fcho1Q8K285 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fcho1Q8K285 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms